肝癌是全球范圍內(nèi)一項重大的健康挑戰(zhàn),其發(fā)病率正在不斷上升。肝細胞癌(HCC)是原發(fā)性肝癌中最常見的類型,約占所有肝癌病例的90%。HCC的治療面臨著復(fù)發(fā)率高、生存期短等難題,而現(xiàn)有的治療手段效果并不理想。因此,迫切需要深入研究驅(qū)動HCC進展的分子機制,以便發(fā)現(xiàn)新的診斷標志物和藥物靶點。
之前的研究發(fā)現(xiàn),HCC中的膽固醇穩(wěn)態(tài)受到嚴重破壞。NPC1(尼曼匹克病C型蛋白1)是一種與膽固醇轉(zhuǎn)運相關(guān)的蛋白質(zhì),在HCC中具有較高的預(yù)后風險評分。作為一種大的跨膜蛋白,NPC1主要定位在晚期內(nèi)體/溶酶體膜上,被認為與膽固醇代謝和病毒感染(如埃博拉病毒)相關(guān)。不過,它在HCC中的確切作用仍不清楚。
近日,國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(北京)姜穎課題組與賀福初院士團隊利用基因敲除(KO)小鼠模型闡明了NPC1在HCC發(fā)生和發(fā)展中的作用。他們發(fā)現(xiàn),NPC1通過控制TGFBR1蛋白的穩(wěn)定性來調(diào)控TGF-β通路,進而促進HCC進展,而這種機制與膽固醇轉(zhuǎn)運無關(guān)。這項成果發(fā)表在《Nature Communications》雜志上,提出了以NPC1為靶點的HCC治療策略。
研究材料與方法
在這項研究中,研究人員使用了多個小鼠模型來研究NPC1的作用,包括小鼠皮下腫瘤模型和尾靜脈轉(zhuǎn)移模型以及DEN/CCl4誘導(dǎo)的HCC模型(CreAlbNpc1F/F和Npc1F/F小鼠由賽業(yè)生物提供)。他們還構(gòu)建了他莫昔芬誘導(dǎo)的肝特異性Npc1基因敲除小鼠模型和MYC驅(qū)動的自發(fā)HCC小鼠模型。他們使用了過表達NPC1和穩(wěn)定敲降NPC1的多個HCC細胞系,并開展了細胞增殖、遷移和侵襲分析。此外,他們還通過環(huán)己酰亞胺追蹤實驗和泛素化分析來檢測TGFBR1蛋白的穩(wěn)定性。
技術(shù)路線
通過體外和體內(nèi)實驗評估NPC1在HCC中的功能
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通過蛋白質(zhì)組學(xué)等分析探索NPC1促進HCC進展的機制,以及是否與膽固醇轉(zhuǎn)運功能相關(guān)
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探索NPC1對TGFBR1蛋白穩(wěn)定性的影響,以及NPC1通過何種機制影響TGFBR1蛋白的穩(wěn)定性
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通過多個小鼠模型來驗證NPC1在調(diào)控TGF-β通路和HCC進展中的作用
研究結(jié)果
NPC1促進了HCC進展
研究人員首先分析了癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)在52%的癌癥類型(包括HCC)中,NPC1在腫瘤組織中顯著上調(diào)。與癌旁組織相比,NPC1在HCC組織中的蛋白和mRNA水平均顯著升高。NPC1高表達患者的總生存期(OS)和無病生存期(DFS)明顯低于NPC1低表達患者。這些結(jié)果顯示,NPC1在HCC中發(fā)揮關(guān)鍵作用。
接下來,研究人員通過體外和體內(nèi)實驗對NPC1在HCC中的功能進行了評估。他們使用了過表達NPC1的PLC/PRF/5細胞以及敲降NPC1的HepG2和MHCC-97H細胞。他們發(fā)現(xiàn),NPC1過表達顯著增強了細胞的增殖、遷移和侵襲能力,而NPC1的沉默則顯著降低了這些能力。在回補NPC1后,這兩種細胞系的增殖、遷移和侵襲能力幾乎完全恢復(fù)。
為了進一步探討NPC1在腫瘤生長和轉(zhuǎn)移中的作用,他們采用了小鼠皮下腫瘤模型和尾靜脈轉(zhuǎn)移模型。在皮下瘤模型中,NPC1基因敲降導(dǎo)致腫瘤大小和重量顯著減少;在尾靜脈轉(zhuǎn)移模型中,NPC1基因敲降導(dǎo)致肺部腫瘤轉(zhuǎn)移顯著減少,進一步證明了它在腫瘤轉(zhuǎn)移中的關(guān)鍵作用。這些結(jié)果顯示,NPC1是促進HCC進展的關(guān)鍵因子。
NPC1以不依賴膽固醇轉(zhuǎn)運的方式調(diào)控TGF-β通路
為了探究NPC1促進HCC進展的機制,研究人員對敲降NPC1的PLC/PRF/5和HepG2細胞進行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析。通路富集分析表明,NPC1敲降顯著抑制了HCC細胞中的TGF-β通路激活,并導(dǎo)致TGFBR1、p-SMAD2和p-SMAD3蛋白水平下降(圖1)。從功能上講,敲降NPC1降低了HCC細胞的遷移能力(圖1)。這些結(jié)果表明,NPC1在促進HCC轉(zhuǎn)移的過程中主要調(diào)控了SMAD2/3的激活。
值得注意的是,在敲降NPC1后,回補NPC1的P691S突變體(膽固醇轉(zhuǎn)運活性缺失)仍能恢復(fù)TGFBR1和p-SMAD2的水平以及細胞遷移能力(圖1),表明NPC1調(diào)控TGF-β通路的方式與其膽固醇轉(zhuǎn)運功能無關(guān)。
圖1. NPC1以不依賴膽固醇轉(zhuǎn)運的方式調(diào)控TGF-β通路
NPC1增加TGFBR1蛋白的穩(wěn)定性并抑制其泛素化
后續(xù)的環(huán)己酰亞胺追蹤實驗表明,NPC1在HCC細胞中的過表達延長了TGFBR1的半衰期,而NPC1的敲降則加速了TGFBR1的降解,強調(diào)NPC1在穩(wěn)定TGFBR1蛋白水平中發(fā)揮作用。利用蛋白酶體抑制劑MG132處理后,他們發(fā)現(xiàn)TGFBR1蛋白水平顯著增加,表明NPC1對TGFBR1降解的調(diào)控是由蛋白酶體介導(dǎo)的。此外,NPC1降低了Lys 48連接的多泛素化水平,而這種泛素化與蛋白酶體降解相關(guān)。這些數(shù)據(jù)表明,NPC1通過抑制Lys 48連接的泛素化,減少了TGFBR1的蛋白酶體降解,進而穩(wěn)定了TGFBR1。
通過免疫共沉淀實驗和細胞共定位分析,研究人員證實了NPC1與TGFBR1存在相互作用,且TGFBR1-NPC1復(fù)合物主要存在于溶酶體中(圖2)。進一步分析表明,NPC1上的氨基酸692-854區(qū)域負責與TGFBR1結(jié)合。在穩(wěn)定敲降NPC1的HCC細胞中,回補NPC1(P691S)可恢復(fù)TGFBR1表達和細胞遷移,但回補NPC1(Δ692-854)則無法挽救這些表型(圖2)。
他們推測NPC1可能通過調(diào)節(jié)TGFBR1與SMAD7或E3連接酶的相互作用來抑制其泛素化。后續(xù)實驗證實了這一點,NPC1過表達減少了TGFBR1與SMAD7及E3泛素酶SMURF1/2的相互作用(圖2)。這些結(jié)果表明,NPC1通過與TGFBR1相互作用并抑制其與SMAD7和SMURF1/2的結(jié)合,保護TGFBR1免受蛋白酶體降解。
圖2. NPC1與TGFBR1相互作用并抑制其與SMAD7/SMURF的結(jié)合
通過對286對人類HCC組織樣本的檢測,研究人員發(fā)現(xiàn)NPC1與TGFBR1的表達之間存在明顯的正相關(guān)。為了探索NPC1是否通過TGFBR1激活來促進HCC進展,他們利用TGFBR1抑制劑(LY2157299)來處理過表達NPC1的PLC/PRF/5細胞。這種處理可明顯減弱NPC1誘導(dǎo)的細胞遷移增強。此外,在小鼠尾靜脈轉(zhuǎn)移模型中,過表達TGFBR1挽救了NPC1敲降細胞的轉(zhuǎn)移潛力。這些結(jié)果表明,TGFBR1對NPC1介導(dǎo)的促進HCC進展至關(guān)重要。
肝臟NPC1缺失抑制TGF-β信號傳導(dǎo)并限制HCC進展
最后,研究人員還委托賽業(yè)生物構(gòu)建了肝特異性的Npc1條件性基因敲除小鼠(CreAlbNpc1F/F)和對照小鼠(Npc1F/F),并通過DEN-CCl4誘導(dǎo)了HCC模型。他們發(fā)現(xiàn),在注射DEN 24周后,對照組小鼠出現(xiàn)了巨大的肝臟腫瘤,而CreAlbNpc1F/F小鼠的腫瘤大小和數(shù)量均明顯下降(圖3)。在MYC驅(qū)動的自發(fā)HCC小鼠模型以及他莫昔芬誘導(dǎo)的Npc1基因敲除小鼠模型中,他們獲得了類似的結(jié)果。
染色結(jié)果顯示,CreAlbNpc1F/F小鼠腫瘤中的侵襲性標志物減少。更重要的是,Npc1基因敲除導(dǎo)致TGFBR1及其下游效應(yīng)物p-SMAD2的表達減少,這也印證了NPC1在調(diào)控TGF-β信號通路中的作用。同時,CreAlbNpc1F/F小鼠的生存時間延長。這些結(jié)果有力地證明了NPC1在調(diào)控TGF-β通路和促進HCC進展中的作用,突出了NPC1的治療潛力。
圖3. 肝臟NPC1缺失抑制HCC腫瘤發(fā)生和進展
結(jié)論
圖4. NPC1調(diào)控TGF-β信號通路的示意圖
這項研究利用肝細胞中缺失Npc1的轉(zhuǎn)基因小鼠模型,確定了NPC1在肝細胞癌中的促腫瘤作用。NPC1與TGFBR1相互作用,阻礙其與SMAD7/SMURF復(fù)合物的結(jié)合,進而減少TGFBR1的泛素化。通過穩(wěn)定TGFBR1蛋白,NPC1調(diào)控了TGF-β信號通路,并促進了癌癥的進展和轉(zhuǎn)移(圖3),而這與其在膽固醇轉(zhuǎn)運中的作用無關(guān)。這些結(jié)果不僅揭示了HCC進展背后的分子機制,也表明NPC1有望成為HCC的預(yù)后標志物和治療靶點。
原文檢索
Li, S., Yan, L., Li, C. et al. NPC1 controls TGFBR1 stability in a cholesterol transport-independent manner and promotes hepatocellular carcinoma progression. Nat Commun 16, 439 (2025). https://doi.org/10.1038/s41467-024-55788-5