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LabChipGX Touch核酸分析系統(tǒng)
LabChipGX Touch核酸分析系統(tǒng)
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產(chǎn)品詳情

LabChip® GX Touch 微流體技術(shù)簡化了平板電泳的諸多人工步驟,并提供對基因組研究,無論是 PCR 前還是 PCR 后的工作流程都至關(guān)重要的樣品完整性及其他各項全面質(zhì)控。

采用便捷的觸摸屏界面,即使是臨時用戶都可很快上手,方便準(zhǔn)備和運行樣品。

LabChip GX Touch 提供:
  • 觸屏點擊式快速樣品分析‒僅需 30 秒/樣品
  • 量化評價 RNA 和 DNA 樣品完整性,確保只有優(yōu)質(zhì)的樣品用于下游分析檢測
  • 最高批處理通量 24 個樣品的高效平臺節(jié)約時間和試劑用量;最高批處理通量 384 個樣品的型號則適用于高通量工作流程
  • 數(shù)據(jù)輸出選項:電泳峰圖、虛擬膠圖或數(shù)據(jù)表格形式
無論您的測序?qū)嶒炇倚枰治鱿∪焙驼滟F樣品,還是運行 PCR-free的流程,亦或是需要對樣品中的每個片段定量以進行基因分型分析,方便易用、成本低、通量高且靈活的 LabChip GX Touch 系列可以極大地減輕分析日益增多的樣品的負擔(dān)。

LabChip GX 觸摸屏簡化了樣品的分析
Touch — 人性化操作
  • 加載樣品板和芯片
  • 選擇樣品(一次最多運行 384 個樣品)
  • 選擇實驗類型
  • 觸點“ 運行 ”,開始實驗
  • 您甚至可以讓系統(tǒng)自動將數(shù)據(jù)直接導(dǎo)出到您的網(wǎng)絡(luò)或 LIMS 系統(tǒng)(圖 2)

運行 — 實時觀察運行
  • 樣品分析耗時少至 30 秒
  • 數(shù)據(jù)采集過程中電泳峰圖實時可見
  • 在運行環(huán)境中將采集到的數(shù)據(jù)疊加比較樣品譜式
  • 挑選不同運行時間分析特征注釋

回顧 — 實時查看數(shù)據(jù)或?qū)С鲆源蘸蠓治?/strong>
  • 選擇以電泳峰圖、虛擬膠圖或數(shù)據(jù)表格形式顯示(圖 3)
  • 使用 TIBCO Spotfire® 數(shù)據(jù)可視化軟件強化分析結(jié)果
  • 收集選擇多板樣品的數(shù)據(jù)進行平行分析比對
  • 挑選過濾具備關(guān)鍵屬性應(yīng)用的數(shù)據(jù)
  • 突出顯示目標(biāo)峰譜
 

圖3. 靈活的數(shù)據(jù)選項允許多種格式的實時查看或?qū)С?/span>
 
LabChip GX Touch 軟件能夠通過少量設(shè)置來進行實驗。實驗設(shè)置參數(shù)文件可下載到儀器上,并通過觸摸按鍵執(zhí)行。自動保留最近一次實驗運行的參數(shù),以方便以相同的實驗參數(shù)繼續(xù)運行多批樣品。數(shù)據(jù)查看軟件模塊可幫助科學(xué)家從遠離實驗室的工作區(qū)查看已完成的樣品。軟件的使用許可證無數(shù)量限制,同事之間可共享數(shù)據(jù),使得項目合作變得簡單而直接。LabChip GX Touch 數(shù)據(jù)文件可與 TIBCO Spotfire 兼容(可選功能)。


只將高質(zhì)量的核酸樣品送到下游
電泳分析是二代測序文庫質(zhì)控的重要環(huán)節(jié),它可同時提供每個樣品的片段大小以及定量信息。LabChip GX Touch 自動完成 DNA 和 RNA 片段以及 smear 樣品的片段大小和濃度分析,用于測序的文庫樣品的質(zhì)控。片段樣品分析通常用于交叉檢驗片段化或者 PCR 步驟的效果。文庫樣品的 DNA 總量分析均一化步驟。

節(jié)約樣品
減少分析時樣品的消耗,是很多實驗室考慮的重要因素。對于諸如染色體免疫共沉淀測序和 PCR-free 等方法制備的濃度非常低的文庫樣品,這一點至關(guān)重要。NGS 3K 試劑盒就是專為這類有特別高靈敏度要求的測序流程而開發(fā)的。LabChip 可以對濃度低至 2.5pg/μL的 smear 以及 0.5pg/μL 的片段進行準(zhǔn)確定量,實現(xiàn)對稀缺和珍貴樣品的快速分析(圖 4)

 
圖4.上 圖 顯 示 了 DNA NGS 3K 檢測樣品的靈敏度。 同一 NGS 文庫樣品進行 6 次 3 倍系列稀釋,實
驗 結(jié) 果 展 示 了 LabChipDNA NGS 3K 檢測樣品濃度 下 限。數(shù) 據(jù) 結(jié) 果 在LabChip GX Touch 儀 器
上展示。
 
快速分析RNA
LabChip Touch 平臺提供了易于理解的 RNA 濃度以及核糖體 RNA 的比例,與 RNA 質(zhì)量評分共同用作完整性評價指標(biāo)(圖 5)。RNA 質(zhì)量評分 (RQS) 是對樣品的質(zhì)量和完整性的量化評價,可預(yù)測下游基因表達實驗(如芯片分析或?qū)崟r PCR 等)的成功幾率。

 
圖5. RNA 電泳圖譜,其中展示 18S 和 28S 峰
 
除 RQS 值外,分析軟件現(xiàn)在可以自動計算DV200 值。這兩個值可以導(dǎo)出,并用于確定來自諸如 FFPE 標(biāo)本的RNA 樣品的質(zhì)量。經(jīng)驗證,RQS 與 Agilent® RIN(RNA完整性指數(shù))密切相關(guān)并遵循相同的 0-10 量化評級。

基因組 DNA 樣品降解評分
為 LabChip GX Touch 系統(tǒng)開發(fā)的基因組 DNA 實驗創(chuàng)新性的引入了基因組 DNA 質(zhì)量評分(GQS),替代傳統(tǒng)的凝膠電泳。所提供的電子數(shù)據(jù),兼容實驗室信息管理系統(tǒng)、可以輕松歸檔和分發(fā)??稍?30 - 60 秒內(nèi)快速分析 25 - 12000bp 的 DNA 樣品(對于 gDNA 完整性檢測上限可達 40000 bp)(圖 6)。

 
圖6.以電泳圖譜展示的基因組 DNA 質(zhì)量評估
 
Small RNA 分析
LabChip® 小 RNA 試劑盒能夠快速分離和測定多種片段范圍在 20 至 150 核甘酸 (nt) 之間的小 RNA 樣品,包括 m i R N A 、 s i R N A 、 p i R N A 、 t R N A 以 及CRISPR-gRNA。這個全新的小 RNA 分析方法可快速自動分析小 RNA 片段大小和相對豐度從而可以達到節(jié)省時間和成本。LabChip® 微流控毛細管電泳技術(shù)能夠在一分鐘內(nèi)自動分離和分 析小 RNA 樣品。系統(tǒng)軟件自動分析數(shù)據(jù),通過采用內(nèi)部參考品 和標(biāo)準(zhǔn)品來確定小RNA 樣品的片段大小和濃度(圖 7)。

 
圖7.LabChip®小RNA檢測方法可自動測定小RNA樣本的片段片段大小,具有很高的準(zhǔn)確度和精密度。

Labchip 電泳
工作原理

LabChip 電泳在小型微流體芯片上進行(圖 8)。將芯片裝載入 LabChip GX Touch 系統(tǒng)后,芯片孔與鉑電極接觸,由鉑電極提供電壓和電流控制。系統(tǒng)機械臂將微孔板上的樣品孔直接移動到芯片的毛細管“ 吸管 ”下方,約 150 nL樣品被抽吸到芯片上。待分析樣品逐一被電泳分離,樣品條帶被激光誘導(dǎo)熒光檢測。通過 ladder 及內(nèi)標(biāo)確定各條帶的大小和濃度。
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