磁珠在核酸純化中的實(shí)驗(yàn)步驟解析
瀏覽次數(shù):214 發(fā)布日期:2025-3-21
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磁珠進(jìn)行核酸純化的工作原理基于磁場(chǎng)分離技術(shù)和特異性吸附機(jī)制,通過(guò)磁珠與核酸分子的相互作用實(shí)現(xiàn)高效分離與純化。
一、磁珠結(jié)構(gòu)與功能
- 核心結(jié)構(gòu)
磁珠由磁性?xún)?nèi)核(如Fe₃O₄、Fe₂O₃)、中間層高分子基質(zhì)(如聚苯乙烯、二氧化硅)和功能化表面基團(tuán)(如羧基、羥基、Oligo(dT))組成。
- 磁性?xún)?nèi)核:提供超順磁性,使磁珠在外加磁場(chǎng)中快速聚集或分離。
- 功能基團(tuán):決定磁珠的吸附特異性(如羧基用于DNA吸附,Oligo(dT)用于mRNA捕獲)。
- 表面修飾技術(shù)
通過(guò)硅烷化、共價(jià)偶聯(lián)等方法修飾基團(tuán),增強(qiáng)核酸結(jié)合能力。例如:
- 羧基磁珠:在高鹽(如NaCl)和PEG條件下,通過(guò)離子橋(DNA-鹽離子-羧基)吸附DNA。
- 硅羥基磁珠:依賴(lài)胍鹽(如GuHCl)破壞核酸水化層,通過(guò)氫鍵和范德華力結(jié)合。
二、核酸提取純化步驟
- 裂解
使用裂解液(含蛋白酶K、SDS等)破壞細(xì)胞膜,釋放核酸。例如:
- 動(dòng)物組織需液氮研磨或蛋白酶K處理。
- 血液樣本通過(guò)紅細(xì)胞裂解液去除紅細(xì)胞。
- 結(jié)合
磁珠與核酸特異性結(jié)合:
- 靜電作用:高鹽環(huán)境屏蔽核酸負(fù)電荷,促進(jìn)與帶正電荷的磁珠表面結(jié)合。
- 疏水作用:PEG誘導(dǎo)核酸分子蜷縮,增強(qiáng)與磁珠的疏水相互作用。
- 氫鍵:核酸磷酸骨架與磁珠表面基團(tuán)形成氫鍵。
- 洗滌
通過(guò)磁場(chǎng)(如達(dá)遠(yuǎn)辰光磁力架提供的穩(wěn)定磁場(chǎng))分離磁珠后,用洗滌液(如75%乙醇)去除蛋白質(zhì)、多糖等雜質(zhì)。需注意:
- 高鹽洗滌液(如TE緩沖液)用于去除污染物,低鹽洗脫液(如ddH₂O)用于釋放核酸。
- 乙醇漂洗需現(xiàn)配現(xiàn)用,避免殘留影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
- 洗脫
調(diào)整條件(如降低鹽濃度、升高pH)破壞核酸與磁珠的結(jié)合,回收純化核酸。例如:
- 羧基磁珠在TE緩沖液中洗脫DNA。
- 硅羥基磁珠需用異丙醇或乙醇沉淀后溶解。
三、關(guān)鍵影響因素
- 鹽濃度
- 高鹽(>0.5M NaCl)促進(jìn)核酸與磁珠結(jié)合,低鹽(<0.1M)用于洗脫。
- 常用離液鹽(如GuHCl、異硫氰酸胍)增強(qiáng)結(jié)合效率,但需后續(xù)去除以避免PCR抑制。
- pH值
- 堿性條件(pH>8)可增強(qiáng)核酸與磁珠的靜電作用,但需控制時(shí)間避免降解。
- 磁珠比例與樣本體積
- 磁珠用量需根據(jù)樣本量調(diào)整(如1μg DNA對(duì)應(yīng)1μl磁珠懸液)。
- 初始體積建議≥100μL,減少移液誤差。
四、技術(shù)優(yōu)勢(shì)與注意事項(xiàng)
- 優(yōu)勢(shì)
- 高通量:適配96孔板自動(dòng)化操作,適合大規(guī)模樣本處理。
- 特異性強(qiáng):通過(guò)功能基團(tuán)選擇性捕獲目標(biāo)核酸。
- 快速:整個(gè)流程可在30分鐘內(nèi)完成。
- 注意事項(xiàng)
- 避免磁珠過(guò)度干燥,否則會(huì)導(dǎo)致結(jié)合能力下降。
- 樣本裂解需充分,否則殘留細(xì)胞碎片會(huì)降低純度。
- 不同磁珠類(lèi)型需匹配特定緩沖體系(如硅羥基磁珠禁用高濃度胍鹽)。
五、應(yīng)用場(chǎng)景
- 病原體檢測(cè):快速分離病毒核酸(如新冠病毒)。
- NGS文庫(kù)構(gòu)建:通過(guò)片段篩選獲得特定長(zhǎng)度DNA。
臨床診斷:自動(dòng)化提取血液、組織中的DNA/RNA。