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WB蛋白樣品制備常見問題及解決方法

瀏覽次數(shù):1746 發(fā)布日期:2022-6-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

一直都在做蛋白研究,但是樣品制備中的小細節(jié)你都了解嗎?這里為大家整理了蛋白樣品制備中大大小小的常見問題,一起來學習吧!


Q:貼壁細胞收集是刮下來好還是胰酶消化好?
A:兩種方式都是可行的,各有利弊。不必擔心刮刀收集會刮壞細胞,胰酶消化的程度掌握不好,也會讓細胞破損。胰酶消化可能會對某些膜蛋白產(chǎn)生影響,刮刀收集效率會略低,可根據(jù)自己的實驗來選擇細胞收集的方式。做總蛋白提取時,可選擇直接在器皿中進行裂解,無需提前收集。

PS:使用刮刀收集時,可加入PBS幫助收取細胞。

 

Q:所有WB實驗都用總蛋白就可以完成嗎?
A:當然不是,要根據(jù)WB的實驗目的來確定提取哪類蛋白,如需驗證某些低豐度蛋白,或蛋白定位,或組分間表達量對比,則需要進行亞細胞結構分離或組分分離。

Q:用RIPA提取總蛋白為什么會有粘稠的不可溶沉淀?是什么?如何解決?
A:產(chǎn)生粘稠物的主要原因是RIPA不能將所有樣品全部裂解,產(chǎn)生的不可溶組分中主要含有核酸殘團,細胞碎片(有些組織樣品還含有油脂),和部分蛋白,因此RIPA提取的僅僅是可溶性蛋白,并非真正的總蛋白。

解決方案:使用柱式法蛋白提取真正意義上的總蛋白

 

Q:不同時間點處理細胞,如何收集進行蛋白提取更合理?
A:最好是收集完細胞后馬上進行蛋白提取。

 

Q:濃度測定哪家強?
A:濃度測定方法很多,目前推薦使用兼容性較好的BCA法進行濃度測定。

 

Q:蛋白樣品如何儲存?
A:蛋白樣品不建議久存,也不要反復凍融。下游做WB實驗,建議蛋白濃度測定后,加入loading buffer煮樣,煮后根據(jù)實驗需要分裝成小管在-80℃,下次使用前拿出小管再次煮樣即可。

 

Q:樣品上樣前怎么處理?
A:蛋白濃度測定后,建議將各個樣品稀釋到某一固定濃度(稀釋可以PBS,水或裂解液),加入loading buffer后,在沸水中煮3-5分鐘,使蛋白充分變性,也可使用PCR儀95度加熱5分鐘。

PS:煮沸并非必須步驟,膜蛋白建議70℃或者更低溫度煮。

煮后在冰上靜置少許時間,進行低速離心,即可上樣。

 

Q:組織樣品含血量多可以直接提蛋白嗎?
A:如組織樣品中含血較多,血紅蛋白可能會影響下游實驗, 可以在組織樣品裂解前使用紅細胞裂解液進行處理后,再進行蛋白提取。
來源:上海雅吉生物科技有限公司
聯(lián)系電話:021-34661276
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