新年首篇Nature Chemical Biology,祝賀浙江大學(xué)王寶俊團(tuán)隊(duì)在Nature Chemical Biology上發(fā)表題為“Programmable trans-splicing riboregulators for complex cellular logic computation”的研究文章。
研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一類(lèi)基于斷裂內(nèi)含子反式剪接的基因調(diào)控技術(shù)(SENTRs),SENTR庫(kù)提供低泄漏表達(dá)、寬動(dòng)態(tài)范圍、高機(jī)器學(xué)習(xí)可預(yù)測(cè)性以及多組分水平的低串?dāng)_。SENTR技術(shù)具有優(yōu)越的可編程性、可預(yù)測(cè)性、正交性、靈活性,可用于RNA檢測(cè)、RNA邏輯計(jì)算以及斷裂生物分子的多輸入復(fù)雜邏輯計(jì)算。
正交性是衡量基因元件質(zhì)量的一項(xiàng)重要指標(biāo),它指多個(gè)元件同時(shí)使用時(shí),相互之間互不干擾的能力。在正交 SENTR 的設(shè)計(jì)和評(píng)估過(guò)程中,研究團(tuán)隊(duì)采用BMG的FLUOstar Omega讀取熒光,計(jì)算熒光比值獲得串?dāng)_水平。
研究團(tuán)隊(duì)也對(duì)RNA反式剪接系統(tǒng)的靈活性、穩(wěn)健性以及應(yīng)用進(jìn)行了進(jìn)一步的探索。通過(guò)下游報(bào)告基因檢測(cè),評(píng)估其調(diào)控功能。研究團(tuán)隊(duì)采用BMG的FLUOstar Omega分別讀取綠色熒光、紅色熒光、藍(lán)色熒光和OD600, 使用Omega MARS 3.32 software數(shù)據(jù)分析軟件進(jìn)行熒光/OD600標(biāo)準(zhǔn)化處理,以檢測(cè)報(bào)告基因。
穩(wěn)定,堅(jiān)固耐用是德國(guó)BMG的FLUOstar Omega多功能酶標(biāo)儀的特點(diǎn)優(yōu)勢(shì),不僅僅在生物合成領(lǐng)域,在基因組學(xué),神經(jīng)退行性疾病診斷,微生物生長(zhǎng)監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域都已經(jīng)得到廣泛的應(yīng)用和用戶(hù)認(rèn)可。
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