磁珠在核酸純化中的實驗步驟解析
瀏覽次數(shù):210 發(fā)布日期:2025-3-21
來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負
磁珠進行核酸純化的工作原理基于磁場分離技術(shù)和特異性吸附機制,通過磁珠與核酸分子的相互作用實現(xiàn)高效分離與純化。
一、磁珠結(jié)構(gòu)與功能
- 核心結(jié)構(gòu)
磁珠由磁性內(nèi)核(如Fe₃O₄、Fe₂O₃)、中間層高分子基質(zhì)(如聚苯乙烯、二氧化硅)和功能化表面基團(如羧基、羥基、Oligo(dT))組成。
- 磁性內(nèi)核:提供超順磁性,使磁珠在外加磁場中快速聚集或分離。
- 功能基團:決定磁珠的吸附特異性(如羧基用于DNA吸附,Oligo(dT)用于mRNA捕獲)。
- 表面修飾技術(shù)
通過硅烷化、共價偶聯(lián)等方法修飾基團,增強核酸結(jié)合能力。例如:
- 羧基磁珠:在高鹽(如NaCl)和PEG條件下,通過離子橋(DNA-鹽離子-羧基)吸附DNA。
- 硅羥基磁珠:依賴胍鹽(如GuHCl)破壞核酸水化層,通過氫鍵和范德華力結(jié)合。
二、核酸提取純化步驟
- 裂解
使用裂解液(含蛋白酶K、SDS等)破壞細胞膜,釋放核酸。例如:
- 動物組織需液氮研磨或蛋白酶K處理。
- 血液樣本通過紅細胞裂解液去除紅細胞。
- 結(jié)合
磁珠與核酸特異性結(jié)合:
- 靜電作用:高鹽環(huán)境屏蔽核酸負電荷,促進與帶正電荷的磁珠表面結(jié)合。
- 疏水作用:PEG誘導(dǎo)核酸分子蜷縮,增強與磁珠的疏水相互作用。
- 氫鍵:核酸磷酸骨架與磁珠表面基團形成氫鍵。
- 洗滌
通過磁場(如達遠辰光磁力架提供的穩(wěn)定磁場)分離磁珠后,用洗滌液(如75%乙醇)去除蛋白質(zhì)、多糖等雜質(zhì)。需注意:
- 高鹽洗滌液(如TE緩沖液)用于去除污染物,低鹽洗脫液(如ddH₂O)用于釋放核酸。
- 乙醇漂洗需現(xiàn)配現(xiàn)用,避免殘留影響后續(xù)實驗。
- 洗脫
調(diào)整條件(如降低鹽濃度、升高pH)破壞核酸與磁珠的結(jié)合,回收純化核酸。例如:
- 羧基磁珠在TE緩沖液中洗脫DNA。
- 硅羥基磁珠需用異丙醇或乙醇沉淀后溶解。
三、關(guān)鍵影響因素
- 鹽濃度
- 高鹽(>0.5M NaCl)促進核酸與磁珠結(jié)合,低鹽(<0.1M)用于洗脫。
- 常用離液鹽(如GuHCl、異硫氰酸胍)增強結(jié)合效率,但需后續(xù)去除以避免PCR抑制。
- pH值
- 堿性條件(pH>8)可增強核酸與磁珠的靜電作用,但需控制時間避免降解。
- 磁珠比例與樣本體積
- 磁珠用量需根據(jù)樣本量調(diào)整(如1μg DNA對應(yīng)1μl磁珠懸液)。
- 初始體積建議≥100μL,減少移液誤差。
四、技術(shù)優(yōu)勢與注意事項
- 優(yōu)勢
- 高通量:適配96孔板自動化操作,適合大規(guī)模樣本處理。
- 特異性強:通過功能基團選擇性捕獲目標核酸。
- 快速:整個流程可在30分鐘內(nèi)完成。
- 注意事項
- 避免磁珠過度干燥,否則會導(dǎo)致結(jié)合能力下降。
- 樣本裂解需充分,否則殘留細胞碎片會降低純度。
- 不同磁珠類型需匹配特定緩沖體系(如硅羥基磁珠禁用高濃度胍鹽)。
五、應(yīng)用場景
- 病原體檢測:快速分離病毒核酸(如新冠病毒)。
- NGS文庫構(gòu)建:通過片段篩選獲得特定長度DNA。
臨床診斷:自動化提取血液、組織中的DNA/RNA。