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代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享:以豬為模型檢測(cè)哺乳動(dòng)物之間的代謝物交換

瀏覽次數(shù):796 發(fā)布日期:2023-1-28  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

百趣代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,您對(duì)哺乳動(dòng)物不同器官之間的代謝物交換情況了解嗎?

本期百趣代謝組學(xué)小趣給大家分享的是美國(guó)普林斯頓大學(xué)Joshua D. Rabinowitz團(tuán)隊(duì)發(fā)表在Cell Metabolism上的研究成果。該團(tuán)隊(duì)以豬為模型,利用高通量靶標(biāo)技術(shù)定量測(cè)定了哺乳動(dòng)物器官之間代謝產(chǎn)物交換。

接下來跟著小趣仔細(xì)看看這篇文獻(xiàn)吧~


 
代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,哺乳動(dòng)物的器官通過循環(huán)不斷地來交換代謝物,但是缺乏對(duì)這種全身性過程的系統(tǒng)級(jí)分析(有助于診斷或治療涉及器官或代謝物的疾。。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,在這篇文章中,作者比較了禁食豬中動(dòng)脈血和11個(gè)器官(肝、腎、腸、結(jié)腸、脾、胰腺、心、肺、腦、耳皮膚和腿部肌肉)的靜脈血中代謝物的濃度,動(dòng)靜脈(AV)濃度差異的測(cè)量是一種公認(rèn)的量化器官特異性代謝產(chǎn)物產(chǎn)生和消耗的方法,其中有超過90%的代謝物在至少一個(gè)器官上顯示出動(dòng)靜脈差異。

下面我們一起來看看這篇文章的結(jié)果:

Part Ⅰ 代謝物交換的一般特征
代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,對(duì)禁食過夜的成年豬(50公斤)進(jìn)行了短暫麻醉,并從動(dòng)脈循環(huán)和特定器官的引流靜脈中抽血,每根血管抽取血液2次,分別獨(dú)立提取血清樣品,用液相色譜-質(zhì)譜法(LC-MS)測(cè)定3次,計(jì)算了引流靜脈(Cv)相對(duì)于全身動(dòng)脈血(Ca)的代謝物豐度的對(duì)數(shù)比, log2(Cv/Ca)大于0表示凈釋放,小于0表示凈吸收,其中,在豬血清中檢測(cè)到280種代謝產(chǎn)物(圖1E),其中91%的代謝產(chǎn)物對(duì)至少一個(gè)器官的AV差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖1E和1F)。
 

圖1 器官間代謝物交換


Part Ⅱ 腎臟代謝
腎臟會(huì)產(chǎn)生葡萄糖和其他特定的代謝產(chǎn)物,包括糖胺(肌酸前體)和絲氨酸,腎衰竭患者的糖胺循環(huán)水平明顯降低,還確定了鳥嘌呤,尿囊酸和乙酸苯酯是其他腎臟特異性代謝產(chǎn)物,它們可能是腎功能不全的有用診斷標(biāo)記(圖2A)。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,作者觀察到血液中代謝物的絕對(duì)濃度與其重吸收效率之間存在相關(guān)性,更豐富的代謝物被更有效地重吸收,但是也有顯著例外,例如尿酸和肌酐(圖2B)。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,腎臟對(duì)代謝物濃度梯度的連續(xù)重吸收需要大量能量,腎臟可以攝取循環(huán)中的TCA(三羧酸)循環(huán)中間體,其中最豐富的是檸檬酸鹽。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,為了確定這些物質(zhì)的流向,作者通過靜脈注射13C標(biāo)記的檸檬酸到小鼠體內(nèi),確認(rèn)腎臟在使用檸檬酸循環(huán)鹽作為燃料方面是特殊的(圖2C D)。
 


圖2.腎臟代謝

Part Ⅲ 葡萄糖和乳酸
為了維持代謝物循環(huán)的穩(wěn)態(tài),每個(gè)代謝物的所有器官的生產(chǎn)和消耗總量必須平衡(包括從飲食中攝取的凈量和從尿液和糞便中排泄的凈量)。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,對(duì)于一個(gè)器官i,凈通量(Fi)可以從AV差值數(shù)據(jù)和文獻(xiàn)數(shù)據(jù)來計(jì)算出絕對(duì)代謝物濃度和區(qū)域血流量。

 


 
Qi是器官的血流量,Ca是動(dòng)脈血中的絕對(duì)代謝物濃度,Ri是測(cè)量到的器官i的引流靜脈與動(dòng)脈血的相對(duì)濃度比

總的來說,葡萄糖的生產(chǎn)和消耗是平衡的,這支持了AV差異數(shù)據(jù)的定量通量解釋。與葡萄糖的交換模式相反,乳酸和丙酮酸具有相同的碳骨架,只是氧化還原狀態(tài)不同。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,丙酮酸在器官特異性的產(chǎn)生和消耗方面與乳酸相似,但有一個(gè)明顯的例外:腎臟吸收乳酸但釋放丙酮酸。因此,腎臟可以氧化乳酸為丙酮酸,從而有助于循環(huán)氧化還原穩(wěn)態(tài)。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,與此一致的是,慢性腎臟疾病與全身氧化還原失衡有關(guān)。
 

圖3.葡萄糖和乳酸

Part Ⅳ 氨基酸
觀察到腿部產(chǎn)生大量谷氨酰胺,推測(cè)主要來自骨骼肌(圖4A)。相反,肝臟消耗谷氨酰胺并分泌谷氨酸,絲氨酸和甘氨酸主要由腎臟產(chǎn)生(圖4B),認(rèn)為腎臟在全身一碳代謝穩(wěn)態(tài)中的重要作用。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,在禁食狀態(tài)下,觀察到腿部對(duì)EAA的凈攝取,循環(huán)EAA水平通過肝臟和腎臟的釋放維持(圖4C),在小鼠中進(jìn)行了13C -亮氨酸示蹤劑輸注,觀察到內(nèi)臟器官的蛋白質(zhì)生產(chǎn)最快,它們是最大的氨基酸消耗者(圖4D)。

 


圖4.氨基酸
 

Part Ⅴ 短酸和長(zhǎng)鏈脂肪酸
除了是葡萄糖和氨基酸的最大消費(fèi)者外,腸道還從腸道微生物群中產(chǎn)生一組獨(dú)特的代謝物(圖1G),最豐富的是短鏈脂肪酸(SCFA),觀察到除了腸道釋放的醋酸外,頭部也大量釋放醋酸(圖5A),這表明大腦可能合成醋酸。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,醋酸鹽隨后被包括肝臟、脾臟、腿部和腎臟在內(nèi)的多個(gè)器官消耗(圖5A)。

與SCFA相比,大多數(shù)器官會(huì)釋放長(zhǎng)鏈脂肪酸(LCFA),對(duì)LCFA種類的詳細(xì)分析顯示出肝臟優(yōu)先消耗不飽和(相對(duì)于飽和)LCFA(圖5C)。相應(yīng)地,腿部?jī)?yōu)先釋放不飽和LCFA(圖5D)。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,使用小鼠中的13C-LCFA同位素示蹤,我們確認(rèn)了不飽和LCFA與飽和LCFA的優(yōu)先肝氧化作用(圖5F),這可能與飽和和不飽和LCFA對(duì)心血管疾病和代謝性疾病的不同作用有關(guān)。
 

圖5.短酸和長(zhǎng)鏈脂肪酸


總結(jié)
在這里,作者提供了一個(gè)器官間代謝物交換的定量圖譜,除了確認(rèn)典型的器官特異性代謝功能,還發(fā)現(xiàn)了意外的代謝物交換情況。代謝組學(xué)文獻(xiàn)分享,展望未來,關(guān)鍵挑戰(zhàn)是AV差異和同位素標(biāo)記數(shù)據(jù)的定量整合,是理解循環(huán)代謝組的穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵一步。


悄悄告訴大家,目前Biotree也有很多相關(guān)的產(chǎn)品,比如說氨基酸高通量靶標(biāo)、短鏈脂肪酸高通量靶標(biāo)等,實(shí)現(xiàn)了高通量、高靈敏度的靶標(biāo)代謝物檢測(cè),為定性、定量檢測(cè)大批量、低豐度代謝物提供了高效方法,歡迎大家前來咨詢呀!

來源:上海百趣生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
聯(lián)系電話:021-61531195
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