原創(chuàng) OLYMPUS生命科學
本文作者:Forest Hill
最近小編和奮戰(zhàn)在科研一線的老同學劉博士聊天時,劉博表示最近很郁悶。自己原本前不久辛辛苦苦養(yǎng)了幾周的細胞,做了實驗后獲得了能夠驗證自己猜測的結(jié)果,本想再重復(fù)一次獲得一個更漂亮更具有說服力的數(shù)據(jù),結(jié)果卻沒能重復(fù)出來......
實驗的可重復(fù)性對于生物研究來說確實是一個老生常談的話題。Nature雜志也曾對1576名科研人員進行網(wǎng)絡(luò)調(diào)查,結(jié)果顯示,超過70%的科研人員無法重復(fù)他人的實驗結(jié)果,超50%無法重復(fù)自己的實驗結(jié)果
*1。
而生物研究結(jié)果的可重復(fù)性較之物理化學等學科難度更大。但是可重復(fù)性以及可重復(fù)性的證據(jù)一直以來都是實驗結(jié)果可靠性的重要證明,尤其是最近科研工作者甚至是科技愛好者對實驗結(jié)果的可靠性也越來越關(guān)注。
圖1 Nature曾對1576名科研工作者做的可重復(fù)性調(diào)查統(tǒng)計
而對于生物研究中需要培養(yǎng)細胞的研究,實驗的可重復(fù)性通常更是一項挑戰(zhàn)。因為細胞不同的數(shù)量、狀態(tài)等都會對精細的生物實驗的結(jié)果造成影響。為了解決這一問題,Nature雜志在同一篇文章中也提出了“更出色的實驗設(shè)計”以及“更優(yōu)化的統(tǒng)計”作為對策。然而,在落實該建議時,如何獲取所需的定量數(shù)據(jù)讓研究人員感到疲憊不堪。
為解決這一問題,我們研發(fā)出了CM20細胞培養(yǎng)監(jiān)控系統(tǒng),可以采集細胞培養(yǎng)的定量數(shù)據(jù),從而提高實驗的可重復(fù)性,也減輕了研究人員采集數(shù)據(jù)的負擔。
傳統(tǒng)難題:
細胞培養(yǎng)階段難以獲得定量數(shù)據(jù)
在傳統(tǒng)的細胞培養(yǎng)流程中,每次細胞數(shù)量的獲取都需要操作人員進行手動計數(shù)。并且細胞培養(yǎng)質(zhì)量判斷和操作時間安排,比如細胞何時傳代、什么樣的狀態(tài)以及多少數(shù)量的細胞可以收獲然后用于下面的實驗等,都由操作人員以主觀方式判斷,但由于判斷標準不同,便會造成不同操作人員之間的實驗結(jié)果差異很大。此外,在采集細胞定量數(shù)據(jù)時,需要取出一部分樣品,缺乏以無損且無污染的方式測量大量數(shù)據(jù)的實用工具。
圖2 傳統(tǒng)的細胞培養(yǎng)流程難以獲得定量數(shù)據(jù)且存在較大個體主觀差異性
我們的解決方案: 使用CM20細胞培養(yǎng)監(jiān)控系統(tǒng)采集定量數(shù)據(jù)
由于CM20細胞培養(yǎng)監(jiān)控系統(tǒng)無需將細胞樣品從培養(yǎng)箱中取出,即可實現(xiàn)自動穩(wěn)定的觀察,因此,無需研究人員干預(yù)就能夠采集到定量數(shù)據(jù)。
CM20還可根據(jù)采集的圖像自動測量細胞數(shù)量獲得細胞的生長曲線,并計算作為細胞增殖能力指標的倍增時間。
圖3 奧林巴斯CM20系統(tǒng)針對傳統(tǒng)細胞培養(yǎng)痛點的解決方案
圖4 使用CM20采集MSC(間充質(zhì)干細胞)圖像并進行細胞計數(shù)
圖5 CM20可對六孔板中培養(yǎng)細胞的生長狀況進行監(jiān)測并同步獲得細胞生長曲線等定量數(shù)據(jù)
應(yīng)用案例:
利用CM20證實HUVEC傳代后的細胞增長率與分化誘導(dǎo)之間的關(guān)系,
且實驗結(jié)果高度可重復(fù)
以下為成功利用CM20細胞傳代定量數(shù)據(jù)進行質(zhì)量評估的示例。在人類臍靜脈內(nèi)皮細胞(HUVEC)傳代培養(yǎng)過程中,使用CM20采集到大量圖像,并分析細胞形態(tài)和倍增時間。
我們發(fā)現(xiàn),HUVEC傳代培養(yǎng)過程中的倍增時間與其血管生成潛力密切相關(guān)。
在本研究中,已經(jīng)證明HUVEC在第8次傳代后倍增時間最長,是增殖能力發(fā)生變化的地方,并具有較好的血管生成潛力。因為整個細胞培養(yǎng)是在CM20的監(jiān)測下進行的,所以HUVEC傳代后的狀態(tài)數(shù)量都被以同一的標準采集并識別分析,因此具有高度可重復(fù)性。
(本結(jié)果使用CM20原型系統(tǒng)獲得*2 ,有關(guān)實驗詳細信息,請參閱《科學報告》相關(guān)論文)
圖6(a)不同傳代次數(shù)后的細胞形態(tài):每次傳代記錄圖像數(shù)據(jù)(b)傳代次數(shù)與細胞增長率之間的關(guān)系:其顯示了HUVEC第8次傳代時的增長率發(fā)生明顯變化(c)HUVEC的血管生成潛力和傳代次數(shù):在P7處較成功的血管生成,在P12處顯示較差的血管生成
參考文獻:
*1) Monya Baker,“1,500名科學家揭開重現(xiàn)性序幕”,《自然》雜志533,452–454(2016年5月26日)
*2) Tatsuya Osaki,Tatsuto Kageyama,Yuka Shimazu,Dina Mysnikova,Shintaro Takahashi,Takimoto Shinichi和Junji Fukuda,“用于穩(wěn)定細胞培養(yǎng)的平板式epi浮雕相襯細胞監(jiān)控系統(tǒng)”,《自然科學報告》 ISSN 2045-2322(在線版)(2017年5月15日)