應(yīng)對蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析的挑戰(zhàn)
質(zhì)譜是蛋白質(zhì)組學的核心分析技術(shù)，但是，大規(guī)模的蛋白質(zhì)組學研究可產(chǎn)生大量
的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。將這些數(shù)據(jù)變成有意義的生物學信息是一個極大的挑戰(zhàn)，每一比特的數(shù)據(jù)就像采集原始數(shù)據(jù)的量一樣大。安捷倫的Spectrum Mill蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析平臺提供了一套高級的軟件工具，用于處理MS和MS／MS譜圖，確定蛋白質(zhì)種類和表達水平，并生成有意義的交叉樣品和交叉實驗結(jié)果總結(jié)。功能包括：
·消除噪音和數(shù)據(jù)庫檢索中不合格數(shù)據(jù)的MS／MS譜圖提取和質(zhì)量評價工具
·支持來自多種儀器類型的多種格式的數(shù)據(jù)分析
·突變鑒定、轉(zhuǎn)錄后變性(PTM)，或者化學變性的MS或MS／MS數(shù)據(jù)的譜庫
檢檢索
·自動和交互式結(jié)果認證，以及采用另外的參數(shù)，模式(強度，異體同形，具有
PTM的異體同形)，或數(shù)據(jù)庫進行重新檢索
·對于一級表達水平比較進行基于質(zhì)量的半定量分析，還支持全ICAT定量
·交叉實驗結(jié)果總結(jié)
·對來自數(shù)據(jù)庫中不存在的蛋白質(zhì)的多肽進行De novo測序
這些功能仔細地集成在一個功能強大的MS蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析解決方案中。