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天木生物助力高校實(shí)現(xiàn)谷氨酰胺酶突變株的高通量篩選

瀏覽次數(shù):1057 發(fā)布日期:2022-9-5  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處
近日,清華大學(xué)張翀、安徽工程大學(xué)薛正蓮研究團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)用DREM cell將液滴微流控技術(shù)與基因編碼熒光生物傳感器相結(jié)合,成功實(shí)現(xiàn)了高產(chǎn)谷氨酰胺酶突變株的超高通量篩選,相關(guān)研究成果以“Combining genetically encoded biosensors with droplet microfluidic system for enhanced glutaminase production by Bacillus amyloliquefaciens”為題,發(fā)表在生物化工領(lǐng)域?qū)I(yè)期刊《Biochemical Engineering Journal》上。

工業(yè)微生物常用于重要的生物和化學(xué)制品的生產(chǎn),優(yōu)良菌株的選育是生物產(chǎn)業(yè)的核心工作之一。近年來合成生物技術(shù)的快速發(fā)展使得高性能工業(yè)菌株基因型的理性構(gòu)建性顯著增加,但如何從海量候選菌株庫(kù)中高通量篩選到規(guī)模生產(chǎn)用的工業(yè)菌株仍面臨挑戰(zhàn)。多孔板(MTP)篩選系統(tǒng)和流式細(xì)胞術(shù)(FACS)是研究者常用的篩選手段,但MTP通量較低,而FACS難以用于檢測(cè)胞外分泌的代謝物。液滴微流控技術(shù)在微生物育種領(lǐng)域的應(yīng)用,成功實(shí)現(xiàn)了大容量突變庫(kù)的全面評(píng)價(jià)以及高效篩選,不僅在篩選通量方面實(shí)現(xiàn)了大幅度提升,有效提高了菌株選育工作效率,而且在篩選成本方面也展現(xiàn)出巨大優(yōu)勢(shì),可顯著降低篩選過程中試劑耗材的用量,將單克隆的篩選成本降低至十分之一或百分之一,實(shí)現(xiàn)高通量、低消耗的優(yōu)良工業(yè)菌株選育。天木生物基于液滴微流控技術(shù)開發(fā)了皮升級(jí)單細(xì)胞分選平臺(tái)--DREM cell(Droplet entrapping microfluidic cell-sorter)具有體積小、通量高、體系封閉、無交叉污染等特點(diǎn),越來越成為科學(xué)研究和企業(yè)生產(chǎn)的重要技術(shù)手段。

清華大學(xué)張翀、安徽工程大學(xué)薛正蓮研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種利用谷氨酸擬熒光蛋白傳感器 iGluSnFR 的谷氨酰胺酶熒光檢測(cè)方法,相較于傳統(tǒng)的高效液相色譜法,速度提高了700倍;趇GlusnFR傳感器,結(jié)合DREM cell單細(xì)胞分選平臺(tái)實(shí)現(xiàn)谷氨酰胺酶生產(chǎn)菌株的高通量篩選,單次實(shí)驗(yàn)可篩選10萬克隆,效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過傳統(tǒng)孔板篩選技術(shù)。最終項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)對(duì)常壓室溫等離子體(ARTP)誘變的解淀粉芽孢桿菌全基因組突變文庫(kù)進(jìn)行超高通量篩選,成功獲得了一株谷氨酰胺酶產(chǎn)量提高47%以上的突變株。該篩選平臺(tái),與微孔板篩選系統(tǒng)相比,篩選率提高500倍,試劑用量減少2萬倍,并且可以節(jié)省大量的多孔板、培養(yǎng)皿、槍頭等耗材。
 
圖丨液滴微流控高通量篩選平臺(tái)流程圖

相關(guān)產(chǎn)品
 
研究團(tuán)隊(duì)所使用的液滴微流控細(xì)胞分選儀(DREM cell)是天木生物基于液滴微流控技術(shù)開發(fā)的皮升級(jí)液滴微流控單細(xì)胞分選平臺(tái),可將待篩選細(xì)胞進(jìn)行包被形成單細(xì)胞微液滴,結(jié)合熒光篩選模型,可以在細(xì)胞水平完成微生物的高通量分離、培養(yǎng)、檢測(cè)、分選等。
 
▲圖丨液滴微流控細(xì)胞分選儀(來源:天木生物)
 
 

高通量皮升級(jí)液滴單細(xì)胞分選系統(tǒng)(DREM cell)相比于傳統(tǒng)篩選方法,篩選效率可提升1萬倍,試劑消耗量可下降至百萬分之一,在篩選通量顯著提升的同時(shí),單克隆篩選成本大幅度降低。該儀器不僅可廣泛應(yīng)用于細(xì)菌、酵母、動(dòng)物細(xì)胞等的高通量篩選,還可以應(yīng)用于蛋白、核酸、抗體等生物大分子篩選等相關(guān)研究領(lǐng)域。
 
項(xiàng)目 技術(shù)參數(shù)
液滴體積 1-1000pL 熒光激發(fā)與檢測(cè)可選波段:
(1)激發(fā)波長(zhǎng)488nm,檢測(cè)波長(zhǎng)525±15nm,靈敏度1μM熒光素/單液滴(2)激發(fā)波長(zhǎng)532nm,檢測(cè)波長(zhǎng)578±11nm,靈敏度100nM試鹵靈/單液滴
液滴生產(chǎn)頻率 0-10000個(gè)/s
液滴分選頻率 0-1000個(gè)/s
微注入速度 0-1000個(gè)/s
樣品低溫控制系統(tǒng) 4℃恒溫控制,±0.5℃
工作環(huán)境 常壓狀態(tài)下,室溫,30%≤濕度≤80%,潔凈暗室
整機(jī)功率 600W
應(yīng)用范圍 細(xì)胞、酵母、細(xì)菌、蛋白、核酸等
 
相關(guān)公司:無錫源清天木生物科技有限公司
聯(lián)系電話:0510-66901819
E-mail:info@biobreeding.com


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