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文庫(kù)片段篩選技術(shù)流程

瀏覽次數(shù):267 發(fā)布日期:2025-3-19  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
磁珠進(jìn)行核酸片段篩選的步驟基于SPRI技術(shù)和磁場(chǎng)分離原理,通過(guò)磁珠與DNA片段的特異性結(jié)合實(shí)現(xiàn)目標(biāo)片段的分離。以下是具體操作流程及關(guān)鍵要點(diǎn):

一、實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備
  1. 磁珠平衡
    將磁珠從冰箱取出,室溫平衡至少30分鐘,避免低溫破壞表面修飾基團(tuán)。
  2. 試劑配制
    • 現(xiàn)用現(xiàn)配80%無(wú)水乙醇(體積比8:2)。
    • 根據(jù)目標(biāo)片段大小選擇磁珠比例(參考各廠家磁珠分選比例表)。

二、雙輪分選法(適用于NGS文庫(kù)構(gòu)建)
第一輪:去除大片段(右側(cè)清除)
  1. 磁珠與樣本混合
    按比例(如0.8×)加入磁珠至DNA溶液中,渦旋混勻或移液器吹打10次,室溫孵育5分鐘。
  2. 磁場(chǎng)分離
    短暫離心后置于磁力架(如達(dá)遠(yuǎn)辰光磁力架),待溶液澄清(約5分鐘),轉(zhuǎn)移上清至新管,殘留2μL液體于原管底部,避免吸到磁珠。
第二輪:去除小片段(左側(cè)清除)
  1. 加入第二輪磁珠
    按比例(如0.2×)加入磁珠至第一輪上清中,重復(fù)混勻、孵育步驟。
  2. 磁場(chǎng)分離與洗脫
    • 分離后棄上清,用80%乙醇漂洗磁珠2次(每次30秒)。
    • 室溫干燥磁珠至剛出現(xiàn)龜裂(約5分鐘),避免過(guò)度干燥。
    • 加入ddH₂O或TE洗脫DNA,室溫孵育5分鐘后回收上清。

三、單側(cè)分選法(適用于去除短片段)
  1. 調(diào)整磁珠比例
    根據(jù)目標(biāo)片段長(zhǎng)度選擇磁珠用量(如去除≥1000bp片段用0.6×,去除≥200bp用2.0×)。
  2. 結(jié)合與分離
    • 混勻磁珠與樣本后孵育5分鐘,磁力架分離并棄上清。
    • 乙醇漂洗后洗脫DNA,適用于去除引物二聚體或短片段雜質(zhì)。

四、關(guān)鍵注意事項(xiàng)
  1. 分選精度控制
    • 第一輪棄磁珠,第二輪棄上清,確保目標(biāo)片段被保留。
    • 使用Qsep、Agilent 2100 Bioanalyzer驗(yàn)證分選后片段分布。
  2. 操作誤差規(guī)避
    • 轉(zhuǎn)移上清時(shí)使用200μL+10μL槍頭,防止吸到磁珠。
    • 初始體積≥100μL,不足時(shí)補(bǔ)超純水以減少移液誤差。

五、應(yīng)用場(chǎng)景示例
  • NGS文庫(kù)構(gòu)建:通過(guò)雙輪分選獲得300-500bp目標(biāo)片段。
  • 病原體檢測(cè):快速分離特定長(zhǎng)度的病毒核酸片段。
如需具體磁珠比例表或?qū)嶒?yàn)參數(shù),可參考廠商提供的說(shuō)明書(shū)(如UltraBio™ II DNA磁珠分選指南)。
來(lái)源:深圳達(dá)遠(yuǎn)辰光科技有限公司
聯(lián)系電話(huà):0755-86727654
E-mail:marketing@longlightech.com

標(biāo)簽: 磁珠分選
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