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人工智能AI應(yīng)用于植物表型領(lǐng)域

瀏覽次數(shù):925 發(fā)布日期:2024-10-15  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

2024年的諾貝爾獎(jiǎng)將人工智能(AI)推向了一個(gè)新的高潮。物理學(xué)獎(jiǎng)和化學(xué)獎(jiǎng)的獲得者都在人工智能領(lǐng)域做出了開創(chuàng)性的貢獻(xiàn)。約翰·霍普菲爾德杰弗里·辛頓因在人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和機(jī)器學(xué)習(xí)方面的奠基性工作而獲得物理學(xué)獎(jiǎng)。

而在化學(xué)獎(jiǎng)方面,一半的獎(jiǎng)項(xiàng)授予了大衛(wèi)·貝克,以表彰其在計(jì)算蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)方面的貢獻(xiàn),另一半則授予了丹米斯·哈薩比斯約翰·喬普,以表彰他們?cè)诘鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方面的成就。這些成就不僅展示了AI在基礎(chǔ)科學(xué)研究中的巨大潛力,也預(yù)示著AI技術(shù)將如何更深入地融入人類生活和科學(xué)研究的各個(gè)方面。

AI與植物表型

AI and Plant Phenotpye

杰弗里·辛頓,被譽(yù)為“深度學(xué)習(xí)之父”,他的工作為深度學(xué)習(xí)的發(fā)展奠定了基礎(chǔ),他提出的玻爾茲曼機(jī),是一種早期的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,它可對(duì)圖像進(jìn)行分類,或者為它所訓(xùn)練的模式類型創(chuàng)建新的案例。它能夠?qū)W習(xí)識(shí)別數(shù)據(jù)中的特征元素,這對(duì)于圖像識(shí)別和其他機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)至關(guān)重要。他的研究推動(dòng)了深度學(xué)習(xí)技術(shù)的快速發(fā)展,使得機(jī)器學(xué)習(xí)在圖像識(shí)別、自然語言處理等多個(gè)領(lǐng)域取得了顯著的進(jìn)展。
 
植物表型研究領(lǐng)域,AI的應(yīng)用也日益廣泛。植物表型由基因和環(huán)境共同影響的,反映植物結(jié)構(gòu)及組成、生長(zhǎng)發(fā)育過程及結(jié)果的全部物理、生理生化特征和性狀,這些特征是植物遺傳學(xué)研究和農(nóng)業(yè)育種的重要依據(jù)。隨著高通量植物表型測(cè)量與分析技術(shù)的發(fā)展,深度學(xué)習(xí)等人工智能方法在植物表型研究中取得了重要進(jìn)展。


水稻穗葉語義分割與表型參數(shù)提取


麥穗實(shí)例分割

例如,慧諾瑞德公司高通量植物表型平臺(tái)TraitDiscover,結(jié)合了先進(jìn)的視覺成像、大數(shù)據(jù)分析和人工智能技術(shù),實(shí)現(xiàn)了全自動(dòng)、高通量的植物表型測(cè)量。通過結(jié)合深度學(xué)習(xí)模型,如PhenoMG-YOLO和PhenoEL-Net,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)植物目標(biāo)的高效檢測(cè)和語義分割,從而精確提取前景和穗葉等關(guān)鍵特征。


基于目標(biāo)檢測(cè)的種子/果蔬計(jì)數(shù)與表型參數(shù)提取

此外,慧諾瑞德公司于今年1月份推出的開源表型小程序OpenPheno,集合了多種植物表型檢測(cè)算法,已發(fā)布了多個(gè)功能模塊,包括籽?挤N、麥穗檢測(cè)、穗葉夾角檢測(cè)、麥穗考種、冠層測(cè)量、番茄考種等。這些模塊結(jié)合了機(jī)器視覺和人工智能技術(shù),如改進(jìn)的YOLOv8模型等,用于植物目標(biāo)檢測(cè)和語義分割,精確提取籽粒、果蔬前景、穗葉等關(guān)鍵特征,從而實(shí)現(xiàn)麥穗檢測(cè)、穗葉夾角計(jì)算和果蔬的形態(tài)參數(shù)獲取。

AI在植物表型研究中的應(yīng)用,不僅提高了數(shù)據(jù)收集和分析的效率,還促進(jìn)了數(shù)據(jù)收集和管理的現(xiàn)場(chǎng)表型分析軟件和工具的開發(fā)。這些工具支持社區(qū)驅(qū)動(dòng)的研究和數(shù)據(jù)共享,為植物表型研究提供了大量的數(shù)據(jù)支持。然而,深度學(xué)習(xí)在植物表型研究中的應(yīng)用,也面臨著一些挑戰(zhàn),如算法的解釋性、模型的泛化能力以及對(duì)大量標(biāo)注數(shù)據(jù)的依賴等。
 
展望未來,隨著AI技術(shù)的不斷進(jìn)步,其在植物表型研究中的應(yīng)用將更加廣泛和深入。結(jié)合Geoffrey E. Hinton等科學(xué)家在AI領(lǐng)域的開創(chuàng)性工作,AI將在植物遺傳學(xué)、農(nóng)業(yè)育種以及精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域發(fā)揮越來越重要的作用,為解決全球糧食安全和可持續(xù)發(fā)展問題提供強(qiáng)有力的技術(shù)支持。
 

來源:慧諾瑞德(北京)科技有限公司
聯(lián)系電話:010-62925490
E-mail:info@phenotrait.com

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