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如何有效避免無處不在的PCR污染

瀏覽次數(shù):991 發(fā)布日期:2023-1-3  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

前言

在PCR檢測過程中,不可否認的是,沒有任何檢測是100%準確的,比如我們可能也曾聽過假陽性這個名詞,那為什么會出現(xiàn)假陽性呢?這其實跟實驗操作過程造成的污染相關(guān),在實驗開展過程中,主要有4種污染途徑:標本間交叉污染、PCR試劑污染、PCR擴增產(chǎn)物污染、實驗室克隆質(zhì)粒污染。

如何對污染進行監(jiān)測?

1. 陽性對照

在建立PCR實驗室及一般的檢驗單位都應(yīng)設(shè)有PCR陽性對照,它是PCR 反應(yīng)是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否符合理論要求的一個重要的參考標志,陽性對照要選擇擴增度中等、復性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標本,如以重組質(zhì)粒為陽性對照,其含量宜低不宜高(100個拷貝以下),但陽性對照尤其是重組質(zhì)粒及高濃度陽性標本,其對檢測或擴增樣品污染的可能性很大,因而當某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定,檢驗人員心中有數(shù)時,在以后的實驗中可免設(shè)陽性對照。

2. 陰性對照

每次PCR試驗務(wù)必做陰性對照,它包括:①標本對照,被檢標本是血清就用鑒定后的正常血清做對照,被檢的標本是組織細胞就用相應(yīng)的組織細胞做對照;②試劑對照,在PCR試劑中不加模板DNA或RNA,進行PCR擴增,以檢測試劑是否污染。

3. 重復性實驗

4. 選擇不同區(qū)域的引物進行PCR擴增

如何避免PCR污染?

實驗室防污染是重中之重,畢竟影響最終檢測結(jié)果,那么我們有哪些防污染的方法呢?

除了注意避免人工操作引入的污染,我們在實驗時應(yīng)設(shè)立適當?shù)年栃詫φ蘸完幮詫φ,陽性對照以能出現(xiàn)擴增帶的最低量的標準病原體核酸為宜,并注意交叉污染的可能性,每次反應(yīng)都應(yīng)由一管不加模板的試劑對照及相應(yīng)不含有被擴增核酸的樣品作陰性對照。同時減少PCR循環(huán)次數(shù),PCR產(chǎn)物達到檢測水平就適可而止。

來源:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
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