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生物素化探針檢測產(chǎn)蛋下降綜合征病毒核酸

瀏覽次數(shù):334 發(fā)布日期:2024-11-23  來源:威尼德生物科技
一、引言
產(chǎn)蛋下降綜合征(Egg Drop Syndrome,EDS)是由產(chǎn)蛋下降綜合征病毒引起的一種以產(chǎn)蛋雞產(chǎn)蛋量顯著下降、蛋殼質(zhì)量變差等為主要特征的傳染病。該病毒屬于腺病毒科禽腺病毒屬,可在雞群中廣泛傳播,給養(yǎng)禽業(yè)帶來嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。
 
傳統(tǒng)的 EDSV 檢測方法包括病毒分離鑒定、血清學(xué)檢測(如血凝抑制試驗(yàn)、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)等)。病毒分離鑒定雖然準(zhǔn)確性高,但操作繁瑣、耗時(shí)較長,需要專業(yè)的實(shí)驗(yàn)室設(shè)備和技術(shù)人員,且對樣品的要求較高;血清學(xué)檢測方法雖然相對簡便快速,但存在一定的假陽性和假陰性結(jié)果,且難以區(qū)分疫苗免疫和野毒感染。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,核酸檢測方法因其特異性強(qiáng)、敏感性高、快速等優(yōu)點(diǎn)逐漸成為病毒檢測的重要手段。本研究利用生物素化探針技術(shù)建立一種針對 EDSV 核酸的檢測方法,以期為 EDSV 的臨床診斷和流行病學(xué)監(jiān)測提供一種更為有效的工具。
二、材料與方法
(一)病毒株與臨床樣本
  1. 病毒株:產(chǎn)蛋下降綜合征病毒標(biāo)準(zhǔn)株由 [保存機(jī)構(gòu)名稱] 提供。
  2. 臨床樣本:采集來自不同地區(qū)疑似產(chǎn)蛋下降綜合征發(fā)病雞場的泄殖腔拭子、輸卵管組織、血清等樣本共 [X] 份,于 -80℃保存?zhèn)溆谩?/li>
(二)主要試劑與儀器
  1. 試劑
    • 生物素標(biāo)記試劑盒([生產(chǎn)廠家])。
    • 核酸提取試劑盒([生產(chǎn)廠家])。
    • 地高辛標(biāo)記的抗生物素抗體([生產(chǎn)廠家])。
    • 化學(xué)發(fā)光底物([生產(chǎn)廠家])。
    • 其他常規(guī)分子生物學(xué)試劑,如 dNTPs、Taq DNA 聚合酶、限制性內(nèi)切酶等均購自知名生物試劑公司。
  2. 儀器
    • 熒光定量 PCR 儀([型號,生產(chǎn)廠家])。
    • 核酸蛋白分析儀([型號,生產(chǎn)廠家])。
    • 凝膠成像系統(tǒng)([型號,生產(chǎn)廠家])。
    • 雜交爐([型號,生產(chǎn)廠家])。
(三)生物素化探針的設(shè)計(jì)與合成
根據(jù) GenBank 中已公布的產(chǎn)蛋下降綜合征病毒的保守基因序列,利用生物信息學(xué)軟件設(shè)計(jì)特異性生物素化探針。探針長度為 [X] bp,其 5' 端標(biāo)記生物素。探針序列經(jīng) BLAST 比對驗(yàn)證其特異性后,由專業(yè)生物合成公司合成。
(四)病毒核酸的提取
采用商品化的核酸提取試劑盒按照說明書分別提取病毒標(biāo)準(zhǔn)株和臨床樣本中的核酸,提取的核酸用核酸蛋白分析儀測定濃度和純度,-20℃保存?zhèn)溆谩?/div> (五)生物素化探針雜交檢測
  1. 點(diǎn)膜
    將提取的核酸樣本和陽性、陰性對照核酸分別點(diǎn)樣于尼龍膜上,每個(gè)樣本點(diǎn)樣量為 [X]μL,然后將尼龍膜置于 80℃烘箱中烘烤 [X] min 以固定核酸。
  2. 預(yù)雜交
    將點(diǎn)樣后的尼龍膜放入裝有預(yù)雜交液的雜交袋中,于雜交爐中 42℃預(yù)雜交 [X] h,以封閉尼龍膜上的非特異性結(jié)合位點(diǎn)。
  3. 雜交
    將生物素化探針加入雜交液中,使其終濃度為 [X] ng/mL,然后將雜交液倒入雜交袋中,42℃雜交 [X] h。
  4. 洗膜
    雜交結(jié)束后,取出尼龍膜,依次用不同濃度的鹽溶液和洗滌液在不同溫度下進(jìn)行洗膜,以去除未結(jié)合的探針,洗膜條件為:先用 2×SSC/0.1% SDS 溶液在室溫下洗膜 [X] min,然后用 0.1×SSC/0.1% SDS 溶液在 65℃下洗膜 [X] min。
  5. 免疫檢測
    將洗膜后的尼龍膜放入含有地高辛標(biāo)記的抗生物素抗體的溶液中,室溫孵育 [X] h,然后用洗滌液洗膜 [X] 次,每次 [X] min。
  6. 化學(xué)發(fā)光檢測
    將洗膜后的尼龍膜與化學(xué)發(fā)光底物孵育 [X] min,然后在暗室中用 X 光膠片曝光,顯影、定影后觀察結(jié)果。
(六)特異性試驗(yàn)
以產(chǎn)蛋下降綜合征病毒標(biāo)準(zhǔn)株核酸為陽性對照,以雞常見的其他病毒(如新城疫病毒、禽流感病毒、傳染性支氣管炎病毒等)核酸為陰性對照,按照上述生物素化探針雜交檢測方法進(jìn)行檢測,評估探針的特異性。
(七)敏感性試驗(yàn)
將產(chǎn)蛋下降綜合征病毒標(biāo)準(zhǔn)株核酸進(jìn)行 10 倍系列稀釋,從 [初始濃度] 開始,共稀釋 [X] 個(gè)梯度,分別提取各稀釋度核酸,然后用生物素化探針雜交檢測方法進(jìn)行檢測,確定該方法能夠檢測到的最低病毒核酸濃度,以評估其敏感性。
(八)臨床樣本檢測
采用建立的生物素化探針雜交檢測方法對采集的臨床樣本進(jìn)行檢測,并與傳統(tǒng)的病毒分離鑒定和血清學(xué)檢測方法(如血凝抑制試驗(yàn))結(jié)果進(jìn)行對比,計(jì)算該方法的符合率。
三、結(jié)果
(一)生物素化探針雜交檢測結(jié)果
在化學(xué)發(fā)光 X 光膠片上,陽性對照樣本出現(xiàn)明顯的雜交信號條帶,而陰性對照樣本無雜交信號條帶。臨床樣本中,[X] 份樣本出現(xiàn)陽性雜交信號,表明檢測到產(chǎn)蛋下降綜合征病毒核酸。
(二)特異性試驗(yàn)結(jié)果
生物素化探針雜交檢測方法僅對產(chǎn)蛋下降綜合征病毒核酸呈陽性反應(yīng),而對雞常見的其他病毒核酸均呈陰性反應(yīng),表明該探針具有高度的特異性,能夠準(zhǔn)確區(qū)分 EDSV 與其他病毒。
(三)敏感性試驗(yàn)結(jié)果
經(jīng)過 10 倍系列稀釋的產(chǎn)蛋下降綜合征病毒核酸檢測結(jié)果顯示,該生物素化探針雜交檢測方法能夠檢測到的最低病毒核酸濃度為 [X] copies/mL,表明該方法具有較高的敏感性。
(四)臨床樣本檢測結(jié)果
對采集的 [X] 份臨床樣本進(jìn)行檢測,生物素化探針雜交檢測方法檢測出陽性樣本 [X] 份,病毒分離鑒定方法檢測出陽性樣本 [X] 份,血凝抑制試驗(yàn)檢測出陽性樣本 [X] 份。與病毒分離鑒定方法相比,符合率為 [X]%;與血凝抑制試驗(yàn)相比,符合率為 [X]%。結(jié)果表明,生物素化探針雜交檢測方法與傳統(tǒng)檢測方法具有較好的一致性,且能更準(zhǔn)確地檢測出臨床樣本中的 EDSV 核酸。
四、討論
本研究成功建立了一種基于生物素化探針的產(chǎn)蛋下降綜合征病毒核酸檢測方法。通過精心設(shè)計(jì)特異性生物素化探針,并優(yōu)化雜交檢測條件,實(shí)現(xiàn)了對 EDSV 核酸的高效、特異檢測。
 
在生物素化探針的設(shè)計(jì)方面,依據(jù) EDSV 的保守基因序列設(shè)計(jì)探針,確保了探針的特異性。同時(shí),在探針的 5' 端標(biāo)記生物素,為后續(xù)的雜交檢測提供了便利。在雜交檢測過程中,對預(yù)雜交、雜交、洗膜等各個(gè)環(huán)節(jié)的條件進(jìn)行了優(yōu)化,如預(yù)雜交時(shí)間和溫度、雜交液中探針濃度、洗膜的鹽濃度和溫度等,這些優(yōu)化措施有助于提高檢測的準(zhǔn)確性和敏感性。
 
特異性試驗(yàn)結(jié)果表明,該生物素化探針能夠準(zhǔn)確識別 EDSV 核酸,而不受其他雞常見病毒核酸的干擾,這為臨床診斷中準(zhǔn)確區(qū)分 EDSV 感染提供了有力保障。敏感性試驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法能夠檢測到較低濃度的病毒核酸,優(yōu)于部分傳統(tǒng)檢測方法,能夠在病毒感染早期或低病毒載量時(shí)進(jìn)行檢測,有利于及時(shí)發(fā)現(xiàn)疫情并采取防控措施。
 
臨床樣本檢測結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了該生物素化探針雜交檢測方法的可靠性。與病毒分離鑒定和血清學(xué)檢測方法相比,具有較高的符合率,且在檢測速度上具有明顯優(yōu)勢。病毒分離鑒定雖然是診斷的金標(biāo)準(zhǔn),但耗時(shí)費(fèi)力,難以滿足臨床快速診斷的需求;血清學(xué)檢測方法易受疫苗免疫等因素影響,而核酸檢測方法直接針對病毒核酸,不受抗體產(chǎn)生的干擾,能更準(zhǔn)確地反映病毒的感染情況。
 
本研究建立的生物素化探針檢測方法在實(shí)際應(yīng)用中具有廣闊的前景。可用于養(yǎng)殖場的日常監(jiān)測,及時(shí)發(fā)現(xiàn) EDSV 感染雞群,采取隔離、消毒等防控措施,減少病毒的傳播和經(jīng)濟(jì)損失。同時(shí),也可應(yīng)用于種雞場的檢疫,防止 EDSV 垂直傳播,保障種雞質(zhì)量和雛雞健康。此外,該方法還可為 EDSV 的流行病學(xué)研究提供重要的技術(shù)支持,有助于深入了解病毒的流行規(guī)律和變異情況。
 
然而,本方法也存在一些不足之處。例如,核酸提取過程相對復(fù)雜,需要一定的儀器設(shè)備和專業(yè)技術(shù)人員操作;生物素化探針的合成成本較高,可能會(huì)限制其在一些基層養(yǎng)殖場的廣泛應(yīng)用。在今后的研究中,可進(jìn)一步探索簡化核酸提取方法,降低探針合成成本,以提高該檢測方法的實(shí)用性和普及性。
 
綜上所述,本研究建立的基于生物素化探針的產(chǎn)蛋下降綜合征病毒核酸檢測方法具有特異性強(qiáng)、敏感性高、快速準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),為產(chǎn)蛋下降綜合征的診斷和防控提供了一種有效的技術(shù)手段,具有重要的理論和實(shí)踐意義。
來源:威尼德生物科技(北京)有限公司
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