差異表達蛋白指的是在不同生物樣本或不同處理條件下，其表達水平發(fā)生顯著變化的蛋白質(zhì)。這種差異表達的觀察對于理解細胞生理和疾病機制是非常重要的。例如，在健康和疾病狀態(tài)下，或者在正常和受到某種處理的細胞之間，某些蛋白質(zhì)可能會上調(diào)或下調(diào)。

1、檢測方法：

最常用的技術(shù)是質(zhì)譜法，特別是液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS/MS）。此外，雙向電泳和Western blot也經(jīng)常被用來研究蛋白質(zhì)的差異表達。

2、定量方法：

可以使用標(biāo)記或非標(biāo)記的定量策略來定量蛋白質(zhì)在不同樣本中的豐度，從而確定哪些蛋白是差異表達的。

3、生物學(xué)意義：

差異表達的蛋白質(zhì)可以為生物過程、細胞通路或疾病提供重要信息。例如，某些差異表達的蛋白可能與疾病進展、藥物反應(yīng)或細胞應(yīng)激反應(yīng)有關(guān)。

4、應(yīng)用：

差異表達蛋白的研究在許多領(lǐng)域都有應(yīng)用，包括癌癥、神經(jīng)退行性疾病、代謝性疾病等。此外，它們也可以作為疾病標(biāo)記物或藥物靶點。

圖1.差異表達蛋白聚類折線圖

注：x軸表示樣品分組，y軸表示表達量。黑色線條表示這個cluster中的所有蛋白在不同實驗條件下相對表達量的平均值的折線圖。

研究差異表達蛋白是蛋白質(zhì)組學(xué)的核心領(lǐng)域，它為我們提供了關(guān)于細胞和組織在不同條件下的功能和狀態(tài)的寶貴信息。