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Western Blot驗(yàn)證蛋白表達(dá)情況

瀏覽次數(shù):1082 發(fā)布日期:2023-7-24  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
一.Western Blot實(shí)驗(yàn)原理
利用SDS-PAGE技術(shù)對蛋白質(zhì)多肽樣品直接進(jìn)行電泳分離,轉(zhuǎn)移多肽/蛋白吸附到固相載體表面材料(如硝酸纖維素薄膜)上(以非共價(jià)鍵形式),并保持電泳分離的多肽/蛋白的類型及其生物學(xué)活性不變。以固相載體上所附著的固定的蛋白質(zhì)/多肽分子片段作為載體抗原,與對應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再分別通過放射性同位素標(biāo)記載體上抗原的二抗起免疫結(jié)合反應(yīng),經(jīng)過熒光吸收顯色技術(shù)或熒光放射同位素自凝顯影等技術(shù)可以分離所得到目的蛋白。
 
二.Western Blot實(shí)驗(yàn)流程
(一)配膠:配置分離儲備膠,ddH2O 4.0 mL、30%儲備膠3.3 mL 1.5 M Tris-HCl 2.5 mL、10% SDS 0.1 mL、10%APS膠0.1 mL。取上述兩種混合液,加以TEMED(N'N'N'N'-四甲基乙二胺)10 μL封底,再加 TEMED 4 μL,混攪勻后灌人入玻璃板槽內(nèi),再加約20%左右的乙醇封頂,注意勿使玻璃液面偏平。配置濃縮膠,ddH2O 1.4 mL、30%儲備膠0.33 mL、1 M Tris-HCl 0.25 mL、10%SDS 0.02 mL、10%APS 0.02 mL、TEMED 2μL。將分離后膠杯內(nèi)壁上的殘存剩余的膠水液傾倒下去,加入了上述剩余的膠混臺液,立即用力將梳子輕輕插入玻璃板孔道間,完全聚合好后還需再放置大約15-30個(gè)min,在再插拔梳子時(shí)還要注意要防止有大量氣泡液體直接流進(jìn)入梳孔孔內(nèi)而導(dǎo)致使整個(gè)梳孔變形。
(二)樣品處理
1.培養(yǎng)的細(xì)胞(定性)
去除培養(yǎng)液細(xì)胞后一定要馬上用溫的PBS液反復(fù)沖洗每個(gè)細(xì)胞的2至3遍為止(冷的PBS有可能使細(xì)胞脫落)。對于6孔板來說每一個(gè)孔都要再加200至300 uL,60至80℃1個(gè)×loading buffer。刮去除下去的細(xì)胞一定要先在EP管中煮沸約10 min,期間一定要渦旋震蕩2至3次。用最后一根清潔干凈后的針尖再次進(jìn)行挑絲,將團(tuán)塊絲全部棄掉,如果您發(fā)現(xiàn)沒有絲狀團(tuán)塊的存在但絲又有了明顯的拉絲現(xiàn)象的現(xiàn)象,可再考慮下將EP管置于0℃后在分別用14000至16000 g進(jìn)行離心和振蕩約2 min,再次進(jìn)行挑絲。若樣品上無明顯拉絲團(tuán)塊或者也是雖然無明顯白色絲狀物團(tuán)存在但樣品溶液里仍然會有些粘稠,可首先通過連續(xù)使用一支1 mL流量的注射器來進(jìn)行連續(xù)反復(fù)多次的抽吸試驗(yàn)來達(dá)到適當(dāng)降低樣品溶液粘滯度,便于在下次進(jìn)行上樣。待樣品溶液逐漸穩(wěn)定恢復(fù)樣品溫度穩(wěn)定到正常的室溫以下后再次上樣。
2.培養(yǎng)的細(xì)胞(定量)
加入適量的冰預(yù)冷后的裂解液混勻后置于冰上10~20 min。刮除取下的細(xì)胞液后收集在EP管腔內(nèi)混勻后注入超聲。12000 g后進(jìn)行離心,4℃,2 min。取下的少量的上廓清液進(jìn)行定量。將以上的所有的蛋白樣品濃度均調(diào)至等質(zhì)量比的濃度,充分均勻的攪拌混合至沉淀后在滴加loading buffer溶液后如果再能直接地進(jìn)行上樣的反應(yīng)是最好,剩余的溶液(溶于1×loading buffer)后就完全可以繼續(xù)用低溫儲存。
3. 組織
心肝脾腎等臟器組織可考慮采用每50至100 mg再加1 mL裂解液,肺組織每100至200 mg后再酌情加用1 mL裂解液?煞謩e通過手動攪拌或單獨(dú)用電動攪拌機(jī)打勻成漿。注意攪拌機(jī)要注意盡量避免長時(shí)間和保持較低溫,快速均勻攪拌才能勻漿。將所有混合的蛋白樣品溫度都調(diào)至一致濃度,充分加熱溶解混合蛋白沉淀液后在加滿loading buffer后再開始直接加熱攪拌直到上樣濃度為最好,注意低溫儲存處理好后剩余蛋白溶液。
(三)SDS-PAGE電泳
上樣檢驗(yàn)工作完畢,在電泳槽溶液漏斗中加入電泳緩沖液,連接電源,負(fù)極在上,正極溶液在下。電泳時(shí),濃縮溶膠電壓約為80 V,分離膠電壓大約是120 V,電泳繼續(xù)進(jìn)行至溴酚藍(lán)行至電泳橫條的下端停止。
(四)轉(zhuǎn)膜
1.前準(zhǔn)備好轉(zhuǎn)移膜的緩沖液、轉(zhuǎn)膜時(shí)用的兩個(gè)小塑料夾子、兩塊塑料海綿墊、一只滴管、一張PVDF轉(zhuǎn)移膜、2大張濾紙。切濾紙膜板和濾膜時(shí)手均須要事先戴并帶好的一次性橡皮手套,PVDF濾膜板先切應(yīng)預(yù)先放置在稀甲醇的溶液中并充分浸泡至少5-10秒,接著再放入平衡液中平衡。
2.取出SDS-PAGE膠,將濃縮膠輕輕向上刮數(shù)下,在膠的一角處做標(biāo)記以方便區(qū)分上樣的順序。放在轉(zhuǎn)膜緩沖液槽中浸泡大約5分鐘以重新平衡離子強(qiáng)度。
3.夾子打開并垂直平放到底部的一個(gè)黑色電極盒內(nèi)(陰極)的中間,放進(jìn)另有一張的黑色海綿墊片,用另一張玻棒子來回反復(fù)的搟打幾遍以幫助均勻地趕走氣泡。取出全部已均勻浸泡在轉(zhuǎn)膜液槽中的剩余凝膠并重新平躺地放在凝膠濾紙板片上,排除掉了所有殘余氣泡。將PVDF轉(zhuǎn)移凝膠膜置于聚丙烯酰胺轉(zhuǎn)移凝膠槽板上,玻棒一定要來回的刮壓幾遍以便能排除去的所有氣泡,注意一定須能在轉(zhuǎn)移凝膠膜槽板的最上端正面作上標(biāo)記(可以將膜的一角剪去或用簽字筆在膜的邊角上做記號)。在轉(zhuǎn)移膜板蓋上先應(yīng)先蓋好另一張已經(jīng)過轉(zhuǎn)移膜緩沖液槽浸泡及清洗處理過后的透明濾紙,亦是須確保轉(zhuǎn)移膜內(nèi)不留任何氣泡。最后再板蓋上應(yīng)另取另外一張透明海綿墊,蓋上陽極板蓋(白色)后,夾緊,保證對凝膠層產(chǎn)生一定壓力。4.將夾子放入轉(zhuǎn)移膜槽中,轉(zhuǎn)膜時(shí)還需再將被轉(zhuǎn)移膜槽放入冰水中循環(huán)進(jìn)行。一般是用恒壓110 V轉(zhuǎn)移時(shí)間約在60 min。特別提示實(shí)驗(yàn)要保證低溫進(jìn)行。
(四)免疫學(xué)檢測
1.取膜,將此膜片的一端正面朝上在1xPBST溶液容器中輕輕上下?lián)u動約五分鐘,洗三次,移至含有封閉液瓶(如含10%脫脂濃縮奶粉的瓶PBST緩沖液容器中保存;稱取脫脂濃縮的奶粉重量約是5 g,PBST約100 mL,溶解均勻后置于冰箱4℃小時(shí)以下保存。使用完畢取出時(shí),恢復(fù)膜在室溫,用量輕輕蓋過此膜面即可。)放在密封良好的玻璃平皿瓶腔中,室溫狀態(tài)條件下放置在脫色搖床上搖動并封閉保存超過1h。
2.取出膜在1xPBST溶液浴中搖動清洗約5分鐘,洗三次,放入1xPBST緩沖液槽中培養(yǎng)(內(nèi)含5%脫脂牛奶),同時(shí)分別加入一抗與二抗到緩沖液槽中,孵育間隔60 min。
3.用1xPBST洗至少三次,5 min/次。
4.化學(xué)發(fā)光,顯影。
 
圖1 WB基本流程(來自卡梅德官網(wǎng)
卡梅德生物在實(shí)驗(yàn)操作細(xì)節(jié)上具有總結(jié)的技巧,有著嚴(yán)格質(zhì)控點(diǎn),嚴(yán)謹(jǐn)?shù)念A(yù)實(shí)驗(yàn)設(shè)置,能夠針對不同客戶的樣品量身定制不同的實(shí)驗(yàn)方案,并提供清晰、完整的Western Blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果,節(jié)省客戶寶貴的科研時(shí)間,以高質(zhì)量滿足客戶需求。
 
三.傳統(tǒng)濕轉(zhuǎn)與半干轉(zhuǎn)的對比
100KD以下蛋白適用半干轉(zhuǎn),且半干轉(zhuǎn)速率快。因?yàn)榘敫赊D(zhuǎn)的電流不會側(cè)漏,全都在濾紙之間,所以轉(zhuǎn)的效率比較高,速度快,缺點(diǎn)是有效離子濃度衰減快,可能大蛋白沒來得及轉(zhuǎn)上,產(chǎn)熱大可能被燒糊。
100KD以上的大分子蛋白的轉(zhuǎn)膜適合用濕轉(zhuǎn)方式,濕轉(zhuǎn)有效電流少,不全在濾紙之間,會從緩沖液間側(cè)漏,所以轉(zhuǎn)的效率低下,速度就慢了,但是有效離子濃度高,能夠長時(shí)間進(jìn)行轉(zhuǎn)膜。

四.內(nèi)參抗體的選擇
(一)考慮實(shí)驗(yàn)樣本來源
1.哺乳動物組織或細(xì)胞樣本:常選用β-actin、β-tubulin、 GAPDH、 Lamin B、Histone H3、Na/K ATPase等。
2.植物來源的實(shí)驗(yàn)樣本,可以選擇plant actin、Rubisco等。
3.其他來源樣本研究較少,需要參照文獻(xiàn)報(bào)導(dǎo)選用合適抗體。
(二)目的蛋白的分子量大。
通常應(yīng)該保證目的蛋白與內(nèi)參蛋白分子量相差5 kDa以上。
(三)目的蛋白的表達(dá)部位:
一般實(shí)驗(yàn)主要是為了準(zhǔn)確檢測胞內(nèi)表達(dá)的特異性蛋白,選擇β-actin、 β-Tubulin、 GAPDH的抗體就可以了;而對于核蛋白的定量,特別是樣本來源于細(xì)胞核內(nèi)蛋白時(shí),常用的核內(nèi)參抗體有Lamin A、Lamin B、Histone H3,除此之外,其它常見的核蛋白內(nèi)參還有PCNA、K70、 K80等,在一些文獻(xiàn)報(bào)道中,Erk2、 TATA binding protein(TBP)以及c-Jun、c-Fos等都有使用;對于膜蛋白檢測,最常用的內(nèi)參抗體為Na/K ATPase;對于線粒體蛋白的檢測,常用VDAC1和COX IV作為內(nèi)參抗體。
 (五)Western Blot實(shí)驗(yàn)的應(yīng)用
1.研究目的蛋白所處的細(xì)胞定位。蛋白的分選投遞與最終發(fā)揮生物功能是受基因活動調(diào)控決定的綜合結(jié)果,因此改變了某些基因的活性,或化學(xué)修飾可能會影響其效應(yīng)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn),改變細(xì)胞核質(zhì)中的分布,引發(fā)一系列不同的生物學(xué)效應(yīng)。
2.對基因的功能缺失研究。通過敲減或過表達(dá)目的基因后,用WB技術(shù)檢測相關(guān)通路蛋白的表達(dá)變化,以確定目的基因激活或抑制目的蛋白的表達(dá)調(diào)控關(guān)系,探究信號通路。
3.檢測細(xì)胞中目的蛋白的表達(dá):通過WB技術(shù)直接檢測干細(xì)胞分化、細(xì)胞自噬、細(xì)胞凋亡、周期蛋白、DNA損傷修復(fù)、分子診斷標(biāo)志物等關(guān)鍵通路蛋白,可評估細(xì)胞或機(jī)體所處的生物學(xué)狀態(tài)。
4.藥物處理、代謝類的研究。
5.蛋白相互作用類的研究。通過WB可檢測Co-IP、RIP、CHIRP等實(shí)驗(yàn)的IP產(chǎn)物,研究目標(biāo)蛋白-蛋白,RNA-蛋白之間的相互作用。 
來源:卡梅德生物科技(天津)有限公司
聯(lián)系電話:400-621-6806 /022-82164980
E-mail:info@kmdbioscience.com

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