細(xì)胞內(nèi)的嘧啶核苷酸主要來(lái)自于從頭合成途徑和補(bǔ)救合成途徑。對(duì)于正常分化的細(xì)胞和靜止的細(xì)胞，補(bǔ)救合成途徑是嘧啶核苷酸的主要來(lái)源。對(duì)于惡性增殖的細(xì)胞來(lái)說(shuō)，補(bǔ)救合成途徑生成嘧啶核苷酸的量無(wú)法維持細(xì)胞生存，細(xì)胞只能依賴于從頭合成途徑。因此，抑制了 DHODH 的活性即可阻止 DNA、RNA、糖蛋白等生物大分子的合成，調(diào)節(jié)細(xì)胞的異常增殖和代謝。近年來(lái)，DHODH 已被確證是多種疾病的治療靶點(diǎn)，如癌癥、病毒性感染、自身免疫性疾�。�類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎和多發(fā)性硬化）等。但是其抑制劑的研發(fā)仍然遇到了許多挫折，比如：長(zhǎng)期使用會(huì)產(chǎn)生很大的毒副作用、抑制劑的脂溶性高、選擇性差。因此，尋找新型高效、副作用小的 DHODH 抑制劑用于治療免疫相關(guān)疾病及腫瘤已經(jīng)成為研究熱點(diǎn)。

本文采用“結(jié)構(gòu)導(dǎo)向”的藥物設(shè)計(jì)方法，尋找類藥性質(zhì)好的 DHODH 抑制劑。首先通過(guò)保留基本的藥效團(tuán)和細(xì)胞活性篩選，獲得了先導(dǎo)化合物 3，其對(duì)DHODH 的 IC₅₀ 為 250 nM。隨后研究者通過(guò)分析 DHODH 蛋白和Brequinar 類抑制劑之間的相互作用，發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)可能形成氫鍵的氨基酸殘基T63 和 Y356，通過(guò)在該位置進(jìn)行結(jié)構(gòu)改造并考慮化合物的理化性質(zhì)（如水溶性和脂溶性），設(shè)計(jì)了一系列 Brequinar 類似物。其中化合物 41（DHODH IC₅₀ = 9.71 nM）和 46（DHODH IC₅₀ = 28.3 nM）具有良好的體外活性和較好的理化性質(zhì)（水溶性提高，cLogP 降低）。（圖1）

圖1.化合物41和46的結(jié)構(gòu)式（圖片來(lái)源：《J. Med. Chem.》）

將化合物合物 46 與 DHODH 蛋白進(jìn)行共晶復(fù)合物的培養(yǎng)，結(jié)果如圖 2 所示。與之前所報(bào)道的 DHODH／Brequinar 類似物共晶復(fù)合物結(jié)果相一致，化合物 46 占據(jù)了由 α1 和 α2 螺旋結(jié)構(gòu)組成的泛醌結(jié)合位點(diǎn)并通過(guò)大量的疏水相互作用與 DHODH 口袋里的殘基側(cè)鏈（L42、M43、L46、P52、A55、A59、F62和T63）形成相互作用（圖2A）。處于更深口袋的萘啶環(huán)可以與附近的疏水殘基（F96、V134、V143、T360、Y356、L359和P364）形成范德華力相互作用（圖2A）。羧基分別與氨基酸殘基Q47、R136、T360形成氫鍵作用、離子鍵作用、水分子介導(dǎo)的氫鍵作用。不同的是，萘環(huán)上新引入的氮原子與 Y356 殘基中的羥基距離為 3.3 Å，可以形成額外的氫鍵作用（圖2B）。

圖2.化合物 46 與 DHODH 的相互作用（PDB: 6CJG）（圖片來(lái)源：《J. Med. Chem.》）

挑選化合物 41 進(jìn)行藥代動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)，小鼠口服給藥時(shí)，化合物具有較長(zhǎng)的半衰期（t_1/2=2.78 h）和較低的清除率，口服生物利用度達(dá)到了 56%。這些優(yōu)異的藥效和藥代動(dòng)力學(xué)參數(shù)使得化合物 41 可以進(jìn)行進(jìn)一步臨床前研究，并成為早期臨床發(fā)展的候選藥物。

由于 DHODH 抑制劑在治療急性髓系白血病具有較好的效果，因此研究者評(píng)估了代表性化合物對(duì) HL-60 細(xì)胞的抗增殖活性。結(jié)果如圖 3 所示，化合物可以較強(qiáng)的抑制 HL-60 細(xì)胞的增殖活性。當(dāng)補(bǔ)充尿苷時(shí)，細(xì)胞的抑制效果減弱，證明化合物是通過(guò)抑制 DHODH 而非細(xì)胞毒來(lái)發(fā)揮作用的，這進(jìn)一步驗(yàn)證了化合物的作用機(jī)制。（圖3）

圖3.DHODH 抑制劑對(duì)白血病細(xì)胞株 HL-60 中的影響（圖片來(lái)源：《J. Med. Chem.》）

小M 的小思考：

嘧啶核苷酸作為細(xì)胞中合成生物大分子的重要原料，對(duì)細(xì)胞增殖、新陳代謝等具有重要意義。由于 DHODH 蛋白是嘧啶核苷酸從頭合成途徑的關(guān)鍵酶，抑制其功能可以抑制一些異常細(xì)胞的增殖，因此是有效治療癌癥、自身免疫性疾病等的重要靶標(biāo)。Brequinar 和 Leflunomide 是以 DHODH 為靶標(biāo)開(kāi)發(fā)的兩個(gè)藥物，其中Brequinar主要用于治療癌癥和自身免疫性疾病，而Leflunomide 是一個(gè)前體藥物，它的活性代謝產(chǎn)物 A771726 能夠用于治療自身免疫性疾病。但臨床研究表明，這兩種藥都存在著不良反應(yīng)，如腹瀉、瘙癢、ALT 和 AST 升高、脫發(fā)、皮疹等，因此尋找高效、低毒的 DHODH 抑制劑依然意義重大。本研究通過(guò)“結(jié)構(gòu)導(dǎo)向”的藥物設(shè)計(jì)策略發(fā)現(xiàn)了高活性且藥代動(dòng)力學(xué)性質(zhì)優(yōu)異的 DHODH 抑制劑，具有重要的研究?jī)r(jià)值。

參考文獻(xiàn)

Madak J T, et al. Design, Synthesis,and Biological Evaluation of 4‑Quinoline Carboxylic Acids asInhibitors of Dihydroorotate Dehydrogenase. J. Med. Chem., 2018, 61 (12),5162–5186.

相關(guān)產(chǎn)品：

Vidofludimus

Vidofludimus(4SC-101; SC12267)是免疫抑制劑，能抑制 DHODH，在不影響淋巴細(xì)胞增殖的條件下抑制 IL-17 的分泌。