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常用核酸提取方法、步驟和注意事項介紹

瀏覽次數(shù):5492 發(fā)布日期:2022-11-26  來源:MedChemExpress
著有 “玄學(xué)” 之稱的分子生物學(xué),師兄師姐說小 M 要做的都是 “升級打怪入門級” 的實驗,然而,實驗記錄本上清晰地羅列著自己整理的堪稱完美的 (假裝看懂的 Steps) 實驗流程,可是完美的流程下,總是充斥著不絲滑的操作——
提 DNA,PCR,電泳,純化回收,構(gòu)載體;提 RNA,反轉(zhuǎn)錄,文庫構(gòu)建,qPCR……如何快速完成一套絕美的逆襲!。

完美操作第一步

打好科研“地基”,從核酸提取開

 

核酸是遺傳信息的攜帶者,是基因表達的物質(zhì)基礎(chǔ),是分子生物學(xué)研究的主要對象。如果要對核酸的結(jié)構(gòu)和功能進行研究,首先就要對核酸進行提取和純化。

 

核酸提取是個啥?字面意思,就是把核酸從樣本中提取出來唄!

那一般常見的提取方法有哪些呢?

 

表 1.核酸提取的常見方法

  • 提取步驟
核酸提取主要包括細胞裂解、核酸吸附雜質(zhì)漂洗核酸洗脫四步。
那具體到實驗中,我們該選擇哪種提取方法呢?這就要看個人的實驗設(shè)計方案及實驗組的經(jīng)費情況啦!
磁珠法提取效果當然很好,但貴是真的貴,而且還得購買配套的磁力架,批量提取的話,還是不太建議的!自配試劑的優(yōu)缺點是顯而易見的,若后續(xù)實驗對核酸要求不高 
(如常規(guī)的 DNA 提取,后續(xù)用做普通 PCR 擴增),這種提取方法也可選擇。

但如果對核酸的質(zhì)量要求比較高 (如定量或文庫構(gòu)建等。尤其不能忽略的是 RNA 提取中的降解和純度問題),小 M 還是比較推薦受眾度較高的離心柱法;至于質(zhì)粒提取,考慮到純度與濃度,肯定也選擇這種性價比較高的離心柱法啦!  

 
圖 1. 離心柱法核酸提取流程圖
 
來來來,排隊隊,順帶開啟 Kits 介紹模式……

 

MCE 新推出三款核酸提取純化試劑盒,均利用硅膠膜離心柱對核酸進行特異性吸附,改良的裂解液可以促進細胞充分裂解、蛋白變性、核酸釋放;改良的吸附緩沖液能有效地促進核酸結(jié)合到硅膠膜上;最后經(jīng)過洗脫即可獲得高純度核酸。
 

Kit one (基因組 DNA 小量抽提試劑盒):我適用于從動物組織/細胞、酵母、大腸桿菌等樣本中有效提取并純化基因組 DNA,內(nèi)含 蛋白酶 K 可去除蛋白污染,經(jīng)純化的基因組 DNA 后續(xù)可用于 PCR、qPCR、酶切、Southern Blot 等實驗。

 
Kit two (病毒 DNA/RNA 抽提試劑盒):我適用于從血漿、血清、全血、組織勻漿液、痰液、動物細胞上清等中提取病毒 DNA/RNA。我不僅包含 蛋白酶 K,更有核酸助沉劑助力,提取的核酸那可不團團來嘛!純化的病毒 DNA/RNA 可用于 PCR、RT-PCR、qPCR 等實驗。
 
Kit three (質(zhì)粒大量抽提試劑盒):我適用于從 ≤500 mL LB 培養(yǎng)基培養(yǎng)的大腸桿菌細胞中高效的提取質(zhì)粒 DNA。RNase A 可對 RNA 進行清除,柱上去除內(nèi)毒素,Very good!
 
MCE 新上線核酸提取試劑盒 (離心柱型),嘗鮮試用裝,抓緊時間領(lǐng)取吧!

 

產(chǎn)品名稱

免費試用裝鏈接

Genomic DNA Mini Purification Kit Free Sample

Viral DNA/RNA Mini Purification Kit

Free Sample

Plasmid DNA Maxi Purification Kit

Free Sample

完美操作第二步

避開操作“雷區(qū)”,拿到高純度核酸

 

 小M:Protocol 很完美,實際操作過程中,也難免會遇到各種小問題。

 


 

下面小 M 對 RNA 提取過程中常見問題進行了一一盤點。

(此處主要針對 RNA 提取,文末彩蛋有 DNA 和質(zhì)粒提取注意事項匯總哦)。
 
 
RNA 提取后續(xù)試驗主要包括 PCR、RT-PCR、qPCR、cDNA 文庫構(gòu)建等,RNA 沒提好,后面的實驗問題也是連貫性的,一個不小心可就都 game over 了。這個 RNA 提取,真的是……腦殼疼!
 

來來來,這道題,我們重點講一下。

 

 

 
 
影響 RNA 得率低的因素很多?
抽提 RNA,當然要做到 “三從四德”。
 
一從:外源酶污染?NO!
二從:內(nèi)源酶活性?NO!
三從:抽提目的性?YES!
 
一德:使用無 RNase 耗材,選擇合適的操作環(huán)境。
二德:確定樣本后選擇合適的裂解液,樣本與裂解程度不匹配,抽提結(jié)果也會大打折扣。
三德:裂解、勻漿、抽提、洗脫——快!準!狠!
四德:衡量抽提性價比的標準是后續(xù)實驗的結(jié)果,得率不是唯一標準。即我們需要明確下一步的實驗,如果是 PCR,其實驗本身對 RNA 的質(zhì)量要求沒有那么高,而 qPCR 對 RNA 的要求相對又高點,但如果要做 cDNA 文庫構(gòu)建,其對 RNA 的要求就很高了,因此 RNA 質(zhì)量便是 “經(jīng)濟基礎(chǔ)” 了,頗有 “一損俱損” 的感覺了。
 
 小白: “三從四德” 我也懂,但 RNA 得率這么低具體是為什么呢?

 小M:還不是因為 RNA 太嬌貴,放太久會降解,環(huán)境不干凈會降解,吹口氣也能降解~

 

 

彩蛋時間到。!

(含 DNA 和質(zhì)粒提取注意事項)
 
 
 


 

 

相關(guān)產(chǎn)品

2× PCR Master Mix (with Dye)

高效、快速的 2× 濃度的即用型預(yù)混液(含溴酚藍),含有常規(guī) PCR 反應(yīng)所需的所有組分(樣品 DNA,引物和水除外)。

2× Fast PCR Master Mix (with Dye)

用于快速 PCR 擴增的 2× 濃度的即用型預(yù)混液(含溴酚藍),含有除樣品 DNA、引物和水外的所有 PCR 成分。

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新型高保真高效率的即用型 PCR 擴增預(yù)混液,適用于高難度長片段的 PCR 擴增實驗。

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采用升級款反轉(zhuǎn)錄酶,反應(yīng)更高效、快速,適用于高 GC 含量、復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)、少量 RNA 模板等。即用型預(yù)混液,一步操作即可完成反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),簡便、快捷。

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反轉(zhuǎn)錄即用型預(yù)混液,采用升級款反轉(zhuǎn)錄酶,反應(yīng)更高效、快速,適用于高 GC 含量、復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)、少量 RNA 模板等。試劑盒配有 gDNA digester 可去除 RNA 模板中的基因組 DNA 污染。

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2× 濃度的即用型預(yù)混液,含有 qPCR 的所有組分,只需加入樣品 DNA,引物和水即可快速高效完成 qPCR 反應(yīng)。

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SYBR Green qPCR Master Mix (High/ Low/No ROX)

2× 濃度的即用型預(yù)混液,含有 qPCR 的所有組分, 只需加入樣品 DNA,引物和水即可快速高效完成 qPCR 反應(yīng)。

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