EVIDENT細胞培養(yǎng)與成像的AI工作流的應用
瀏覽次數(shù):1523 發(fā)布日期:2022-10-26
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EVIDENT細胞培養(yǎng)與成像的AI工作流,文末專屬福利來襲
細胞培養(yǎng)與實驗是生命科學研究、再生醫(yī)學研究和藥物開發(fā)的基礎。但是培養(yǎng)高質量的細胞需要注意很多地方,而且需要不菲的成本。對細胞進行成像和分析并且成為專家需要相當長的一段時間。
Evident將先進的光學和軟件技術與人工智能相結合,為細胞實驗提供了簡單有效的整體工作流。

1、細胞培養(yǎng)
為了進行精準的實驗,需要制備在標準條件下培養(yǎng)的細胞。CM20可安裝在培養(yǎng)箱中觀察記錄細胞培養(yǎng)整個過程。
容器類型:六孔板 時間間隔:3小時 監(jiān)控周期:7天
容器類型: T25 時間間隔: 3小時 監(jiān)控周期:20天
使用CM20進行細胞培養(yǎng)主要有以下三個優(yōu)點:
優(yōu)點一:無需從培養(yǎng)箱中取出樣品,無需進入CPC。無需浪費容器進行評估,并可消除污染、培養(yǎng)基擾動等影響細胞狀態(tài)的因素。

優(yōu)點二:由于可以利用AI技術通過測定細胞數(shù)量和密度等定量數(shù)據(jù)來判斷培養(yǎng)條件,因此可以消除人為誤差和操作者之間不同造成的細胞質量差異。
優(yōu)點三:可盡早發(fā)現(xiàn)細胞死亡等異常現(xiàn)象,減少時間和成本。此外,還可以確定傳代或開始實驗的理想時間。
細胞培養(yǎng)質量監(jiān)控的重要性:為了保證實驗的可靠性,同步進行實驗是很重要的。例如,在最近的一項研究中,我們利用倍增時間和毛細血管長度來評估HUVECs在不同傳代數(shù)下的血管生成活性。最終發(fā)現(xiàn)倍增時間在第8傳代時達到最大值;從第5代到第8代,分支數(shù)增加,然后迅速減少。所以我們在后續(xù)實驗中應該維持細胞在八代以內,以控制干細胞的質量。

Osaki, T., Kageyama, T., Shimazu, Y. et al. Flatbed epi relief-contrast cellular monitoring system for stable cell culture. Sci Rep 7, 1897 (2017).
2、成像
當細胞培養(yǎng)到合適狀態(tài)后,我們從培養(yǎng)箱中取出樣品進行實驗。利用傳統(tǒng)顯微鏡進行成像,操作比較復雜,并且需要較長時間才能獲取理想的圖像。APX100是一個新概念的成像儀器,旨在任何人都可以輕松和快速獲得高質量的圖像。

它主要具有以下這三個方面的特點:
特點一:智能樣本導航功能通過簡單地放置樣本獲得導航圖,并使用人工智能識別樣本的位置。使得我們使用顯微鏡拍攝樣品的第一個困難——找到樣品變得更加簡單。
特點二:簡潔直觀的交互操作讓我們輕松可以獲取多維度的照片,比如多色、Z層切、時間序列、多位點。
特點三:高質量的光學系統(tǒng),高靈敏度的探測器,可獲得與傳統(tǒng)顯微鏡相比更加高質量的圖像。結合優(yōu)化的Trusight模塊,APX100可幫助我們獲得接近共聚焦級別的圖像。
3、分析
為了觀察細胞的熒光強度、形態(tài)和動態(tài)的時間變化,對細胞的準確識別是必不可少的。然而,當細胞的形態(tài)復雜時,這是更具挑戰(zhàn)性的。而容器的灰塵或劃痕、染色或標記蛋白表達不足會增加難度。
Evident的TruAI提供了克服這些挑戰(zhàn)的機會。TruAI使用深度學習準確有效地識別每個細胞,并為您提供必要的參數(shù),如強度、大小和速度等。
• TruAI能夠和CM20聯(lián)合使用,用于實時監(jiān)測細胞的生長運動狀態(tài),獲得運動軌跡,速度等定量數(shù)據(jù)。
圖一:CM20獲取細胞培養(yǎng)原圖;圖二:TruAI識別細胞圖;圖三:軌跡追蹤結果圖
圖一:CM20獲取局部細胞培養(yǎng)原圖;圖二:TruAI識別局部細胞圖;圖左三:局部軌跡追蹤結果圖;圖四:軌跡追蹤結果
cellSens輸出數(shù)據(jù)(包括軌跡區(qū)域 位移 時間 速度 長度 角度等)
• TruAI能夠從單通道圖像中識別單個細胞及其核,即使是細胞密度比較大的情況下。

• TruAI能夠在微弱信號之下識別細胞。

在以上種種技術支持之下,Evident能夠提供從細胞培養(yǎng)到分析的整個工作流程。
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