5.技術(shù)優(yōu)勢(shì)

• 適用范圍廣：可檢測(cè)到的蛋白除了胞漿蛋白外，還有線粒體蛋白、膜蛋白和核蛋白。也能對(duì)任何類型的蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定，包括高分子量，酸性，堿性蛋白質(zhì)；
• 高通量：一次可以實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品的定性定量分析，特別適用于采用多種處理方式或來自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析；
• 結(jié)果可靠：基于高靈敏度和高分辨的串聯(lián)質(zhì)譜方法，定性與定量同步進(jìn)行，同時(shí)得出定性和定量結(jié)果，重復(fù)樣品間的蛋白表達(dá)量相關(guān)性高；
• 靈敏度高：分級(jí)分離，降低樣品復(fù)雜度，相比凝膠電泳觀測(cè)到的蛋白變化在2倍以上，iTRAQ計(jì)算出的蛋白變化在1.3-1.6倍之間，可檢測(cè)低豐度蛋白；
• 分離能力強(qiáng)：可分離出酸/堿性蛋白，小于10KDa或大于200KDa的蛋白、難溶性蛋白等；
• 自動(dòng)化程度高：液質(zhì)聯(lián)用，自動(dòng)化操作，分析速度快，分離效果好。

6.技術(shù)參數(shù)

• 本要求：

動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本 100 mg/sample
血清、血漿 200μL/sample
細(xì)胞 、微生物 1×107 cells/sample
植物嫩葉、嫩芽 500mg/sample
植物種子 200mg/sample
植物果肉 20g/sample

 

• 儲(chǔ)存和運(yùn)輸：

液氮或-80℃保存；足量干冰運(yùn)輸，避免反復(fù)凍融。

 

• 檢測(cè)平臺(tái)：

7.應(yīng)用方向

• 臨床生物學(xué)及藥理學(xué)應(yīng)用方向

生物疾病標(biāo)志物研究；生物疾病發(fā)生發(fā)展過程分子機(jī)制研究；化學(xué)或生物藥物作用靶點(diǎn)研究；化學(xué)或生物藥物作用機(jī)理信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究。

• 農(nóng)林業(yè)等應(yīng)用方向

畜牧業(yè)領(lǐng)域：提高肉類品質(zhì)和飼養(yǎng)條件；農(nóng)業(yè)領(lǐng)域：農(nóng)作物發(fā)育機(jī)制的研究；食品科學(xué)領(lǐng)域：提高食品安全，改善口感和營養(yǎng)程度的研究；病毒領(lǐng)域：新型病毒抑制因子的挖掘研究。


8.案例分享
應(yīng)用TMT技術(shù)研究由于年齡和高脂飲食引起的小鼠附睪脂肪組織蛋白質(zhì)組的變化 
Extended Multiplexing of Tandem Mass Tags (TMT) Labeling Reveals Age and High Fat Diet Specific Proteome Changes in Mouse Epididymal Adipose Tissue
研究?jī)?nèi)容：小鼠附睪脂肪組織的TMT蛋白質(zhì)組學(xué)
發(fā)表期刊：Molecular & Cellular Proteomics
影響因子：IF=6.54
研究背景：
肥胖癥是一種世界性流行病，與代謝并發(fā)癥如2型糖尿病、高血壓、血脂異常和動(dòng)脈粥樣硬化的發(fā)病率增加有關(guān)。過去由于缺乏有效的高通量技術(shù)手段限制了對(duì)附睪組織的整個(gè)白色脂肪組織蛋白質(zhì)組變化的研究。因而作者利用多組高通量TMT標(biāo)記定量蛋白組技術(shù)對(duì)小鼠附睪組織的蛋白質(zhì)組進(jìn)行了深入的研究。
實(shí)驗(yàn)樣本：
將20只8周齡的小鼠進(jìn)行低脂或高脂飲食的喂養(yǎng)，時(shí)間為短(8周)或長(18周)(每個(gè)實(shí)驗(yàn)組5只小鼠)。收集附睪脂肪，溶解，取100mg進(jìn)行胰蛋白酶消化。用TMT-10plex標(biāo)記樣品和pool樣本，合并上機(jī)后分為9個(gè)餾分。報(bào)告離子強(qiáng)度使用內(nèi)部參考標(biāo)度(IRS)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。差異表達(dá)的蛋白質(zhì)通過edgeR的篩選來確定，并通過基因富集和網(wǎng)絡(luò)分析進(jìn)行表征。
實(shí)驗(yàn)策略：
采用了三組TMT-10-plex試劑盒進(jìn)行標(biāo)記。
分析軟件：
Proteome Discoverer(1.4.1.14 version,Thermo Scientific), SEQUEST
分析策略：
Volcano plots ,Pearson correlation, Network analysis, Gene Enrichment
研究路線：

生信分析：

6.百趣協(xié)助客戶發(fā)表文獻(xiàn)
（可點(diǎn)擊標(biāo)題或圖片閱讀原文）


1. 通過調(diào)節(jié)微環(huán)境和代謝選擇性對(duì)抗缺氧腫瘤的高效Pt（IV）前藥研究
CAIXplatins: highly potent Pt(IV) prodrugs selectively against hypoxic tumors via microenvironment and metabolism regulation

發(fā)表期刊：Angewandte Chemie International Edition
 

發(fā)表時(shí)間：2020
影響因子：12.959
作者單位：中山大學(xué)
涉及的百趣服務(wù)產(chǎn)品：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組
樣本類型：人細(xì)胞
主要研究?jī)?nèi)容：
缺氧和酸性微環(huán)境在腫瘤轉(zhuǎn)移和血管生成中起著至關(guān)重要的作用，通常會(huì)損害化療效果。作者開發(fā)了兩種靶向碳酸酐酶IX（CAIX）的鉑（IV）前藥CAIXplatins，采用iTRAQ蛋白組等實(shí)驗(yàn)方法研究了其設(shè)計(jì)的合理性和功效，結(jié)果表明CAIXplatins對(duì)CAIX有著很強(qiáng)的親和力和抑制性，不僅可以克服腫瘤缺氧和酸性微環(huán)境的問題，也可以抑制缺氧癌細(xì)胞的代謝通路， 而且CAIXplatins的腫瘤選擇性是順鉑/奧沙利鉑的70~90倍，其全身副作用也得到了有效緩解，因此具有非常廣闊的臨床應(yīng)用前景。 

2. 慢性低氧誘導(dǎo)的Cirbp高甲基化會(huì)弱化低溫狀態(tài)下的心臟保護(hù)作用
Chronic hypoxia–induced Cirbp hypermethylation attenuates hypothermic cardioprotection via down-regulation of ubiquinone biosynthesis

發(fā)表期刊：Science Translational Medicine
發(fā)表時(shí)間：2019
影響因子：16.71
作者單位：中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院
涉及的百趣服務(wù)產(chǎn)品：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組
樣本類型：大鼠心臟組織
主要研究?jī)?nèi)容：
在體外循環(huán)（CPB）期間通常使用治療性低溫來保護(hù)心臟免于心臟手術(shù)中的心肌損傷。而患有慢性缺氧（CH）的患者在心臟手術(shù)后具有嚴(yán)重心肌損傷的高風(fēng)險(xiǎn)，但其潛在機(jī)制尚不清楚。文章首先利用iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)現(xiàn)了Cirbp信號(hào)軸中的多個(gè)重要蛋白，并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行深入的分子生物學(xué)研究。結(jié)果表明CIRBP-COQ6/9-CoQ10軸受損是造成Cirbp-/-大鼠嚴(yán)重心肌損傷和術(shù)后心功能不全的原因，而CoQ10補(bǔ)充的心臟停搏液改善CH大鼠的心臟保護(hù)作用。這是一項(xiàng)非常具有臨床意義的研究，為CH患者提供了個(gè)性化心臟保護(hù)策略的潛在可能性。

3. 棕櫚烯酸在急性前葡萄膜炎中的作用研究
Analysis of the role of palmitoleic acid in acute anterior uveitis

發(fā)表期刊：International Immunopharmacology

發(fā)表時(shí)間：2020
影響因子：3.943
作者單位：重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院 
涉及的百趣服務(wù)產(chǎn)品：GC-MS、TMT標(biāo)記定量蛋白組
樣本類型：人糞便、細(xì)胞
主要研究?jī)?nèi)容：
作為最常見的葡萄膜炎實(shí)體，急性前葡萄膜炎（AAU）損害眼睛前段的正常功能和結(jié)構(gòu)，前期研究發(fā)現(xiàn)患者與健康人之間糞便中棕櫚烯酸（PA）濃度存在顯著差異，本文主要使用GC-MS和TMT定量蛋白組等方法在體內(nèi)體外實(shí)驗(yàn)中探討PA在 AAU發(fā)病中的作用，結(jié)果表明AAU患者糞便中PA的表達(dá)明顯增加。PA在臨床和實(shí)驗(yàn)葡萄膜炎的發(fā)病機(jī)制中都起著作用。其作用可能是通過改變樹突狀細(xì)胞和CD4+T細(xì)胞的功能和分化來介導(dǎo)的。PA在小鼠模型中對(duì)樹突細(xì)胞和CD4+T細(xì)胞有免疫調(diào)節(jié)作用，并減輕疾病的嚴(yán)重程度。 

4. 大腸桿菌中產(chǎn)廣譜β-內(nèi)酰胺酶的潛在機(jī)制研究
Proteomics and metabolomics analysis reveal potential mechanism of extended-spectrum blactamase production in Escherichia coli

發(fā)表期刊：RSC Advances
發(fā)表時(shí)間：2020
影響因子：3.119
作者單位：吉林大學(xué)
涉及的百趣服務(wù)產(chǎn)品：TMT標(biāo)記定量蛋白組、LC-MS/MS非靶代謝組學(xué)
樣本類型：大腸桿菌
主要研究?jī)?nèi)容：
在本研究中，應(yīng)用TMT蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的聯(lián)合分析來比較β-內(nèi)酰胺類抗生素敏感大腸桿菌和產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸桿菌（ESBL-EC）菌株之間蛋白質(zhì)和代謝物的差異，結(jié)果表明超廣譜β-內(nèi)酰胺酶的存在影響大腸桿菌的代謝物和蛋白質(zhì)譜，差異蛋白和差異代謝物可能在ESBL-EC的抗生素耐藥性中起重要作用。該研究可以在代謝物和蛋白質(zhì)水平上為ESBL-EC抗生素耐藥性的機(jī)制研究提供科學(xué)數(shù)據(jù)，針對(duì)這些途徑的調(diào)節(jié)劑可能對(duì)ESBL-EC菌株的治療有效并揭示臨床大腸桿菌菌株的抗生素抗性機(jī)制。