通過Discovery Studio軟件設(shè)計(jì)指導(dǎo)了變構(gòu)肽配體（Altered peptide ligands，APLs）用于治療I型糖尿病。

I型糖尿病在人類和非肥胖糖尿病小鼠中均是一種自身免疫系統(tǒng)缺陷的疾病，有研究表明其主要由于CD8+ T細(xì)胞介導(dǎo)的β細(xì)胞損傷，使之不能正常分泌胰島素。變構(gòu)肽配體（Altered peptide ligands，APLs）可以有效抑制抗原-特異性T細(xì)胞失效，凋亡或轉(zhuǎn)移。因此開發(fā)有效的APLs用于I型糖尿病的治療很有必要。本文通過分子模擬技術(shù)對變構(gòu)肽配體進(jìn)行了設(shè)計(jì)和優(yōu)化。

文章作者基于已知的變構(gòu)肽配體與受體的復(fù)合物結(jié)構(gòu)，首先通過Discovery Studio突變了復(fù)合物結(jié)構(gòu)中的關(guān)鍵氨基酸殘基，確定了變構(gòu)肽的關(guān)鍵改造位置，并設(shè)計(jì)了8個(gè)變構(gòu)肽配體。然后結(jié)合DS_Loop refinement和分子動(dòng)力學(xué)程序Standard Dynamics Cascade對8個(gè)變構(gòu)肽配體的復(fù)合物進(jìn)行了結(jié)構(gòu)模擬和優(yōu)化，并基于MM-PBSA方法預(yù)測了它們與受體之間的結(jié)合能，根據(jù)預(yù)測結(jié)果（表1）選擇其中四個(gè)肽進(jìn)行了合成和生物活性測試，其中變構(gòu)肽H6F活性較好。針對H6F進(jìn)行了后續(xù)的試驗(yàn)研究，試驗(yàn)結(jié)果表明變構(gòu)肽配體H6F有希望成為一個(gè)治療I類糖尿病的藥物。