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代謝組學(xué)的優(yōu)勢(shì)、應(yīng)用及研究?jī)?nèi)容介紹

瀏覽次數(shù):7910 發(fā)布日期:2017-4-1  來(lái)源:麥特繪譜

我們知道細(xì)胞內(nèi)的生命活動(dòng)由眾多基因、蛋白質(zhì)、以及小分子代謝產(chǎn)物來(lái)共同承擔(dān),而上游的(核酸、蛋白質(zhì)等)大分子的功能性變化最終會(huì)體現(xiàn)于代謝層面,如神經(jīng)遞質(zhì)的變化、激素調(diào)控、受體作用效應(yīng)、細(xì)胞信號(hào)釋放、能量傳遞和細(xì)胞間通訊等,所以代謝組處于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和蛋白質(zhì)作用網(wǎng)絡(luò)的下游,所提供的是生物學(xué)的終端信息。如同我們?cè)陂L(zhǎng)江的上游建大壩或?qū)牡溃@些項(xiàng)目的生態(tài)影響會(huì)在下游的河道和地域體現(xiàn)出來(lái)一樣,我們經(jīng)常說(shuō),基因組學(xué)和蛋白組學(xué)告訴你可能發(fā)生什么,而代謝組學(xué)則告訴你已經(jīng)發(fā)生了什么。

選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢(shì)有哪些?

  • 代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。
  • 小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。
  • 代謝物的種類少,大約在103個(gè)數(shù)量級(jí),要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡(jiǎn)單得多,分析起來(lái)更簡(jiǎn)單明了。
  • 代謝組學(xué)的代謝物信息庫(kù)簡(jiǎn)單,它遠(yuǎn)沒(méi)有全基因組測(cè)序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫(kù)那么復(fù)雜。
  • 基因和蛋白質(zhì)表達(dá)的有效微小變化會(huì)在代謝物上得到放大,從而使檢測(cè)更容易。
  • 代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些?

  • 疾病機(jī)制研究
  • 疾病診斷與防治
  • 新藥篩選和開發(fā)
  • 藥物作用機(jī)制的研究
  • 藥物毒性評(píng)價(jià)
  • 植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究
  • 微生物代謝組學(xué)研究

代謝組學(xué)可以檢測(cè)的樣品種類有哪些?

代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(分子量<1000)。其樣品主要是血漿或血清,尿液,唾液,以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位(如煙草公司、茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等)合作,做過(guò)植物,真菌,微生物提取物,腦脊液,淋巴液,昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,精液,胎盤,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。

一般代謝組學(xué)能檢測(cè)出多少物質(zhì)?

不同的質(zhì)譜平臺(tái)靈敏度及偏向性都不一樣,而且不同平臺(tái)之間具有互補(bǔ)性。一般來(lái)說(shuō)GC/MS檢測(cè)血清樣品能準(zhǔn)確定性的物質(zhì)約200個(gè)左右,檢測(cè)尿液樣品定性的物質(zhì)約200個(gè)左右,其他樣品(如肝臟,糞便,腸道內(nèi)容物)也在幾百這個(gè)數(shù)量級(jí)。如果采用全二維GC/MS,物質(zhì)的數(shù)量要更多,可達(dá)1千以上。LC/MS檢測(cè)物質(zhì)的數(shù)量要遠(yuǎn)比GC/MS多,但能準(zhǔn)確定性和定量的不多,視不同的平臺(tái)(TQ、QTOF等)能達(dá)到幾十至2-3百個(gè)物質(zhì)。

代謝組學(xué)研究的內(nèi)容和流程

 

發(fā)布者:麥特繪譜生物科技(上海)有限公司
聯(lián)系電話:400 867 2686
E-mail:marketing@metaboprofile.com

標(biāo)簽: 代謝組學(xué)
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