羅氏FFPE 組織切片核酸純化試劑盒操作說明
瀏覽次數(shù):7093 發(fā)布日期:2015-4-6
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High Pure FFPET DNA Isolation Kit基于離心柱法的抽提原理,免去DNA沉淀和有機試劑抽提的步驟,是快速核酸抽提的理想工具。
整個抽提過程僅需3小時(含脫蠟過程); 獲得高DNA得率和質(zhì)量; 在qPCR,芯片分析和測序等下游應用中獲得強大信號。 |
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圖1:從FFPET樣本中獲得高得率的DNA
柱形圖顯示了從3種不同乳腺癌或結(jié)腸癌異種移植組織的5um FFPET組織切片樣品中獲得的DNA平均得率。通常來說,在不同組織切片的樣品個體間存在一定的DNA得率變異。
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圖2:從樣品中抽提獲得高質(zhì)量DNA,適用于多種下游應用。 在HT29異種移植FFPET樣本中抽提獲得DNA,再進行100,200,300,400bp片段長度擴增子的多重PCR。 泳道1和2:使用二甲苯進行脫蠟 泳道3和4:使用十六烷進行脫蠟 泳道5和6:多重PCR質(zhì)控對照,核酸樣品為人全血中抽提的完整基因組DNA 圖2:從近期和長期保存的FFPET樣品中均可抽提獲得高RNA得率 | |
結(jié)果:所有泳道中均出現(xiàn)4個清晰的目標條帶,表明High Pure FFPET DNA Isolation Kit能在FFPET樣本中抽提獲得高質(zhì)量DNA,適用于CGH芯片分析,二代測序等對核酸模板質(zhì)量要求高的下游應用。 |
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圖3:從樣品中抽提獲得高質(zhì)量DNA,提高qPCR檢測靈敏度
作為qPCR實驗中的核酸模板,要求高質(zhì)量DNA,即良好的核酸得率、純度和片段大小分布,并能高靈敏度和不偏倚地檢測到目標基因。取5ul DNA洗脫液,分別通過LightCycler 480 Real-Time PCR Instrument擴增檢測CycA(442bp)或myo(89bp)基因片段。 結(jié)果:High Pure FFPET DNA Isolation Kit抽提獲得的DNA樣品能在qPCR研究中獲得更高的檢測靈敏度(提前出線的Cq值)。
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圖4:將DNA應用于甲基化敏感性高分辨率熔解曲線分析(MS-HRM)等前沿應用
將不同腫瘤研究樣本的DNA抽提物經(jīng)重亞硫酸鹽處理,通過LightCycler 480 Instrument進行APC基因的MS-HRM分析,不同腫瘤組織的APC基因具有不同程度的甲基化。
結(jié)果:使用High Pure FFPET DNA Isolation Kit抽提獲得的DNA是MS-HRM分析的理想模板。在該研究中,共發(fā)現(xiàn)3中不同程度的甲基化范圍:樣本A的APC甲基化水平在10-100%,樣本B的甲基化水平在0-1%,樣本C的APC不存在甲基化。 | |
產(chǎn)品信息 |
產(chǎn)品 |
目錄號 |
包裝規(guī)格 |
High Pure FFPET DNA Isolation Kit |
06 650 767 001 |
50次抽提反應。 | |
閱讀原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2015040006.html