小白：新課題確定了，導(dǎo)師想要我研究 XXX 關(guān)于 XXX 的疾病的研究，在選產(chǎn)品呢，蛋白，抑制劑，一一搜索 ing…

小 M：你是怎么選的？

小白：比如 EGFR, 在官網(wǎng)搜索框點(diǎn)擊 EGFR, 進(jìn)入靶點(diǎn), 勾選類(lèi)別,選擇排名在前的產(chǎn)品仔細(xì)研究。

 

小M：方法是個(gè)好方法，還有更便捷的方式 -- 基因作用數(shù)據(jù)庫(kù)。

小白：？？？這是個(gè)什么數(shù)據(jù)庫(kù)~

小M：這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)基于海量熱門(mén)基因，整合了來(lái)自 HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee)，NCBI (national center for biotechnology information)，Ensembl (Ensembl genome browser 107），OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man)，和 Gene Cards 等各大權(quán)威數(shù)據(jù)中心，混合與多類(lèi)型數(shù)據(jù)庫(kù)的交互方式。同時(shí)，數(shù)據(jù)庫(kù)也配套提供了關(guān)聯(lián)疾病及化合物庫(kù)。

下面一起看看具體功能吧！

■ Quick Search 功能

通過(guò) Search 基因名或基因符號(hào)，就可以看到該基因在不同物種下的所有名目。還是以 EGFR 為例，檢索后可以一覽該基因所屬的信號(hào)通路、同源信息，以及組織表達(dá)情況。

■ Flexible Browse 功能

點(diǎn)擊特定基因，進(jìn)入到詳情頁(yè)面。各個(gè)模塊集中展示了研究工作中重點(diǎn)關(guān)注信息�？梢愿鶕�(jù)基因-蛋白-疾病-產(chǎn)品的順序，或點(diǎn)擊上方的浮動(dòng)工具欄，按需獲取基礎(chǔ)信息。

例如蛋白模塊，下方列出了多種蛋白名稱(chēng)用法，來(lái)源于已有研究/出版刊物的使用記錄。高頻率名稱(chēng)將推薦為主名。

小白：是很方便，但我還有個(gè)疑問(wèn)，比如我就想選擇一個(gè) EGFR 重組蛋白，下面列出這么多，我該怎么判斷？

小M：下方列出的重組蛋白可用直接從名稱(chēng)上知悉一二。

例如紅色框的內(nèi)容表明它是重組 EGFR 蛋白，綠色框表明來(lái)源物種，藍(lán)色框則說(shuō)明了蛋白長(zhǎng)度、表達(dá)體系、融合標(biāo)簽、以及是否生物素化。“蛋白編號(hào)” 列關(guān)聯(lián)了 Uniprot 這個(gè)蛋白資源寶庫(kù)，有更多好奇心的童鞋可以再探索更多信息~

(2) 常見(jiàn)的表達(dá)體系有 E.coli、CHO、Sf9、赤畢酵母等。

E.coli 適用于原核來(lái)源或無(wú)需翻譯后修飾的真核蛋白。CHO 是哺乳動(dòng)物細(xì)胞，具有表達(dá)穩(wěn)定、蛋白修飾準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn)。Sf9 昆蟲(chóng)細(xì)胞則是桿狀病毒常用的表達(dá)宿主。赤畢酵母是甲醇營(yíng)養(yǎng)酵母，可提取高純度重組蛋白。最后，應(yīng)根據(jù)具體情況選擇合適的表達(dá)系統(tǒng)。

(3) 融合標(biāo)簽是免疫分析的重要幫手，一般可增強(qiáng)蛋白可溶性、屏蔽毒性蛋白。應(yīng)選擇大小合適的標(biāo)簽用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

(4) 生物素化不干擾分子固有功能，可特異性結(jié)合鏈霉親和素或抗生物素蛋白，增加實(shí)驗(yàn)設(shè)定。 
 

小白：聽(tīng)起來(lái)好像有了些課題靈感。那么小分子抑制劑呢？人源鼠源都是EGFR，下面這些都是有用的產(chǎn)品？

小M：一般情況下，小分子藥物不區(qū)分種屬 (但是也要多看文獻(xiàn)!) 下面的 “關(guān)聯(lián)產(chǎn)品” 模塊按臨床階段分類(lèi)，并進(jìn)一步細(xì)分為生物活性分子及抗體抑制劑 (需要注意種屬)。

1. 示例產(chǎn)品與 MCE 的產(chǎn)品目錄直接交互，點(diǎn)擊 可以跳轉(zhuǎn)產(chǎn)品詳情頁(yè)，了解試劑的更多生物信息。詳情頁(yè)還提供有體內(nèi)外的實(shí)驗(yàn)示例哦，附有實(shí)驗(yàn)條件和設(shè)定結(jié)果，小白你就不用為新產(chǎn)品入手太發(fā)愁了。

2. MCE 基因作用數(shù)據(jù)庫(kù)套用了 MedChemExpress (MCE) 專(zhuān)有罕見(jiàn)病產(chǎn)品庫(kù)，幫助你進(jìn)一步選取研究重心、開(kāi)拓課題版圖。

3. 對(duì)于臨床中的產(chǎn)品，還詳盡展示了對(duì)應(yīng)的具體臨床階段